More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0210 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  100 
 
 		 330 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  65.14 
 
 		 329 aa  421  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  66.11 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  63.04 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  64.29 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  62.65 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  62.96 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  50.6 
 
 		 349 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  50.3 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.78 
 
 		 337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  51.13 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  50.63 
 
 		 349 aa  322  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  53.53 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  50.32 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.55 
 
 		 343 aa  315  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  48.36 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  46.97 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  46.97 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  46.97 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  46.97 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  46.97 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  46.97 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  50.95 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  46.97 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  50.95 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  46.93 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  46.93 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  46.93 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  46.36 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  46.93 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  46.93 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  50.63 
 
 		 353 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  55.05 
 
 		 318 aa  311  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.15 
 
 		 337 aa  311  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  48.77 
 
 		 462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  45.9 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  45.18 
 
 		 369 aa  305  7e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  50.97 
 
 		 322 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  44.87 
 
 		 341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  55.63 
 
 		 319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  45.19 
 
 		 390 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  57.14 
 
 		 323 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  44.98 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  52.4 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  52.56 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  45.85 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.28 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  43.02 
 
 		 359 aa  298  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  44.65 
 
 		 350 aa  297  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  47.62 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  45.27 
 
 		 451 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  47.22 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02167  hypothetical protein  46.95 
 
 		 327 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.8 
 
 		 348 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  45.13 
 
 		 486 aa  295  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  46.18 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  47.54 
 
 		 411 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  50.62 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  44.61 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.89 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  53.58 
 
 		 317 aa  292  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  48.2 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3302  NADH dehydrogenase subunit H  45.75 
 
 		 325 aa  291  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  46.63 
 
 		 416 aa  291  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  45.85 
 
 		 345 aa  291  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  46.5 
 
 		 472 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  46.32 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  47.56 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  48.24 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  48.85 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  48.24 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  46.32 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  49.01 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  43.03 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1810  NADH dehydrogenase subunit H  45.75 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639781 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  45.87 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  46.08 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1460  NADH dehydrogenase subunit H  45.75 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.87 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  49.67 
 
 		 333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  50.32 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  43.6 
 
 		 345 aa  288  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  49.17 
 
 		 466 aa  288  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1566  NADH dehydrogenase subunit H  45.42 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  49.19 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.71 
 
 		 340 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  48.38 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1693  NADH dehydrogenase subunit H  48.54 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>