114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0726 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  100 
 
 		 57 aa  121  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1441  YHS domain-containing protein  84.62 
 
 		 56 aa  93.6  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0620316  normal  0.0208977 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  75 
 
 		 56 aa  90.5  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  70.37 
 
 		 55 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  61.4 
 
 		 56 aa  77  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  63.16 
 
 		 56 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  56 
 
 		 796 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  61.9 
 
 		 861 aa  70.5  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  51.85 
 
 		 1020 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  57.78 
 
 		 823 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  61.7 
 
 		 47 aa  65.5  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 		 809 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  50.94 
 
 		 793 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 		 795 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  56.25 
 
 		 799 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  59.09 
 
 		 786 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2219  hypothetical protein  59.18 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.221281  normal  0.0750414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  57.78 
 
 		 767 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 787 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  51.92 
 
 		 836 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  56.52 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  54.17 
 
 		 804 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  52 
 
 		 441 aa  59.3  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 806 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  52.94 
 
 		 846 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  47.17 
 
 		 801 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 794 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  53.33 
 
 		 973 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 787 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  47.92 
 
 		 868 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  55.56 
 
 		 49 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  51.11 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  53.49 
 
 		 788 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 846 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  46.81 
 
 		 841 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  47.73 
 
 		 928 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  48.08 
 
 		 792 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  53.33 
 
 		 48 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 		 908 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  48.94 
 
 		 737 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  45.45 
 
 		 821 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  56.52 
 
 		 48 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  52.38 
 
 		 773 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  48.98 
 
 		 778 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 		 781 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 801 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  43.4 
 
 		 796 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  53.49 
 
 		 353 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 		 833 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 		 798 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  48.94 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  51.16 
 
 		 841 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 		 814 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 		 811 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  39.62 
 
 		 804 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 837 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0605  hypothetical protein  46 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 777 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 		 817 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 		 817 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  47.06 
 
 		 466 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0617  YHS domain-containing protein  54.17 
 
 		 57 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000102849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 895 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  53.49 
 
 		 776 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 		 835 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  41.67 
 
 		 425 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  51.06 
 
 		 831 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  44.19 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 831 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 815 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 815 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0169  YHS domain protein  54.76 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 787 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 815 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  43.4 
 
 		 786 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1146  YHS domain protein  48.89 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0140786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 		 785 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 		 786 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 		 786 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 		 765 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0603  YHS domain-containing protein  56.82 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000661026  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0020  YHS domain-containing protein  42 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 755 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  44.44 
 
 		 805 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 		 810 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 		 782 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 797 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  42.86 
 
 		 372 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  48.84 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.168888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  47.62 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  47.62 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 826 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  41.51 
 
 		 795 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  47.83 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  41.51 
 
 		 791 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  38.98 
 
 		 463 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  41.51 
 
 		 838 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 806 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2275  YHS  41.86 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 816 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>