86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2219 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2219  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.221281  normal  0.0750414 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  71.11 
 
 		 47 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 861 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  59.18 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  56.25 
 
 		 56 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  54.55 
 
 		 49 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  54.9 
 
 		 56 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  59.52 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1441  YHS domain-containing protein  55.32 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0620316  normal  0.0208977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0605  hypothetical protein  48 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  53.06 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  58.14 
 
 		 48 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  54.76 
 
 		 48 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  52.27 
 
 		 846 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 1020 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  42.86 
 
 		 441 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  51.16 
 
 		 767 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  51.16 
 
 		 846 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 		 793 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  42 
 
 		 796 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 928 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  43.75 
 
 		 737 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 786 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 794 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  39.22 
 
 		 804 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 799 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  52.27 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  44.23 
 
 		 786 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  44.23 
 
 		 786 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 868 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 823 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0020  YHS domain-containing protein  48.84 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  55.81 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  48.84 
 
 		 805 aa  48.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 792 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 809 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 795 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2517  YHS domain protein  52.63 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  0.0264071 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 788 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 801 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 810 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  37.25 
 
 		 895 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  45.24 
 
 		 353 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 841 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 776 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  41.86 
 
 		 806 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  45.65 
 
 		 902 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 818 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 841 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  38.3 
 
 		 821 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  35.85 
 
 		 787 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 773 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  42.86 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 801 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 797 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 		 908 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 973 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 		 814 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 817 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1146  YHS domain protein  45.24 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0140786 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 837 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2275  YHS  35.29 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 817 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0617  YHS domain-containing protein  54.76 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000102849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  41.07 
 
 		 809 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 831 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  34.62 
 
 		 781 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.86 
 
 		 346 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.168888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 		 787 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  36.96 
 
 		 787 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 815 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 815 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 815 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  45.24 
 
 		 466 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  37.78 
 
 		 786 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 755 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0603  YHS domain-containing protein  54.76 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000661026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 		 835 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 798 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 778 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  37.25 
 
 		 826 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 		 833 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 796 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  53.57 
 
 		 354 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  57.69 
 
 		 517 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>