More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1212 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  100 
 
 
902 aa  1837    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  47.74 
 
 
928 aa  445  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  48.88 
 
 
918 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  40.15 
 
 
752 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  40.47 
 
 
786 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
806 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1129  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
840 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.979362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
787 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 
846 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  39.42 
 
 
814 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  39.33 
 
 
747 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  37.37 
 
 
787 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  38.15 
 
 
744 aa  385  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  36.31 
 
 
838 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1536  heavy metal translocating P-type ATPase  40.45 
 
 
813 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  37.97 
 
 
791 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  37.97 
 
 
795 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 
811 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  36.88 
 
 
826 aa  358  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
793 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  36.6 
 
 
778 aa  354  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.02 
 
 
805 aa  352  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
798 aa  347  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  33.93 
 
 
837 aa  347  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  37.09 
 
 
645 aa  346  1e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  35.2 
 
 
762 aa  346  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 
786 aa  346  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  35.34 
 
 
762 aa  346  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 
786 aa  346  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  35.21 
 
 
828 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  35.85 
 
 
644 aa  332  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  45.76 
 
 
767 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  43.81 
 
 
759 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  43.81 
 
 
759 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  35.18 
 
 
955 aa  316  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  39.11 
 
 
781 aa  313  6.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  39.11 
 
 
781 aa  313  6.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  35.33 
 
 
961 aa  313  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  42.78 
 
 
735 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  46.95 
 
 
762 aa  311  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  35.33 
 
 
955 aa  311  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  38.21 
 
 
750 aa  310  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  44.6 
 
 
827 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  45.38 
 
 
836 aa  308  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  45.38 
 
 
836 aa  308  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  44.76 
 
 
750 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  44.29 
 
 
735 aa  306  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  44.24 
 
 
826 aa  305  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  41.42 
 
 
822 aa  304  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  42.71 
 
 
815 aa  304  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  42.71 
 
 
815 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  46.03 
 
 
819 aa  304  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  42.93 
 
 
846 aa  304  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  42.71 
 
 
815 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  45.07 
 
 
799 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  42.16 
 
 
793 aa  302  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  45.03 
 
 
831 aa  303  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  42.89 
 
 
851 aa  303  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  43.57 
 
 
753 aa  302  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  44.82 
 
 
852 aa  302  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  44.05 
 
 
856 aa  302  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  45.14 
 
 
855 aa  301  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 
840 aa  301  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  43.35 
 
 
826 aa  301  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  43.62 
 
 
724 aa  301  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
797 aa  301  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  44.42 
 
 
833 aa  300  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  42.72 
 
 
831 aa  300  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  41.08 
 
 
795 aa  299  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  43.9 
 
 
758 aa  300  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  43.62 
 
 
804 aa  300  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  39.43 
 
 
724 aa  299  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  44.06 
 
 
761 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  46.2 
 
 
895 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.08 
 
 
805 aa  297  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  41.36 
 
 
721 aa  297  6e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  43.29 
 
 
736 aa  297  7e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  44.35 
 
 
737 aa  297  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
837 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  32.79 
 
 
805 aa  296  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  41.58 
 
 
801 aa  295  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
839 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  42.12 
 
 
829 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
828 aa  295  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
762 aa  295  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  44.38 
 
 
1020 aa  295  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.62 
 
 
794 aa  295  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
755 aa  294  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  43.62 
 
 
818 aa  294  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
857 aa  294  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  32.79 
 
 
805 aa  294  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  32.94 
 
 
806 aa  294  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  35.24 
 
 
845 aa  294  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
762 aa  294  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  44.1 
 
 
841 aa  294  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  42.97 
 
 
736 aa  294  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  43.04 
 
 
833 aa  294  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  40.14 
 
 
767 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  40.08 
 
 
835 aa  293  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  42.78 
 
 
796 aa  293  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>