82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1146 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1146  YHS domain protein  100 
 
 
59 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0140786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  44.9 
 
 
928 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  47.73 
 
 
861 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  45.1 
 
 
793 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
973 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 
846 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  52.38 
 
 
301 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  45.65 
 
 
49 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 
788 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 
795 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
787 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  50 
 
 
299 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
817 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
801 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  47.73 
 
 
805 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
817 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 
772 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
1020 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  53.33 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  44.23 
 
 
56 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
895 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 
826 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
908 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
796 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  45.83 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  48.89 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
833 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 
796 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  42.22 
 
 
441 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  45.24 
 
 
786 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  41.18 
 
 
767 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  45.24 
 
 
786 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
818 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  50 
 
 
56 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.74 
 
 
814 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 
786 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
799 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  43.75 
 
 
48 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
841 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
831 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  42 
 
 
868 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 
794 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
809 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
783 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  37.78 
 
 
841 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  52.27 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2275  YHS  37.5 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2312  YHS domain protein  43.14 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  40 
 
 
902 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0020  YHS domain-containing protein  38.3 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  36.96 
 
 
48 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
801 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
823 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
787 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  39.58 
 
 
49 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  42.22 
 
 
47 aa  44.3  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
786 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.1 
 
 
353 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  46.81 
 
 
466 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  36.17 
 
 
804 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2219  hypothetical protein  45.24 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.221281  normal  0.0750414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  38.64 
 
 
806 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
810 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  40.91 
 
 
354 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  30.77 
 
 
804 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
836 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.283973 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  34.09 
 
 
295 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  34.69 
 
 
787 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.1 
 
 
346 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
846 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
816 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  34.04 
 
 
821 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
835 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
815 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  33.96 
 
 
737 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
815 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  42.86 
 
 
372 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
815 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
811 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  34 
 
 
776 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
798 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1441  YHS domain-containing protein  42.86 
 
 
56 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0620316  normal  0.0208977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>