73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2275 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2275  YHS  100 
 
 		 167 aa  347  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1941  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  49.12 
 
 		 785 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  54.35 
 
 		 826 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  48 
 
 		 781 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 928 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  44.9 
 
 		 773 aa  51.2  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 		 835 aa  50.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 801 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 793 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 811 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  41.67 
 
 		 767 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  47.83 
 
 		 821 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 787 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 788 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 1020 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 818 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 833 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  51.06 
 
 		 56 aa  48.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 787 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 841 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  45.24 
 
 		 56 aa  47.8  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 792 aa  47.8  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 		 765 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 794 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 846 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  41.86 
 
 		 801 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  41.51 
 
 		 301 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0605  hypothetical protein  40.82 
 
 		 62 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  44.9 
 
 		 787 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1146  YHS domain protein  37.5 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0140786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 973 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  44.64 
 
 		 777 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  52.27 
 
 		 826 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 796 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  38.18 
 
 		 805 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 823 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 778 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 786 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  40.43 
 
 		 841 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 837 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  44.19 
 
 		 466 aa  44.7  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  38 
 
 		 786 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  41.86 
 
 		 57 aa  44.3  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 908 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2219  hypothetical protein  35.29 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.221281  normal  0.0750414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  36.36 
 
 		 48 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 810 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 895 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 		 772 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 831 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 799 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  36.17 
 
 		 861 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0617  YHS domain-containing protein  39.58 
 
 		 57 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000102849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 806 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 		 798 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  36.51 
 
 		 804 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 836 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  41.03 
 
 		 441 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 868 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  42.86 
 
 		 737 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  42.22 
 
 		 133 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  42.86 
 
 		 84 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  42.86 
 
 		 56 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 797 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 816 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1441  YHS domain-containing protein  40.48 
 
 		 56 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0620316  normal  0.0208977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 809 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  35.56 
 
 		 902 aa  41.6  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  40.48 
 
 		 295 aa  41.6  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0603  YHS domain-containing protein  40.91 
 
 		 59 aa  41.2  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000661026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 796 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 806 aa  40.8  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>