More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0224 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0224  dihydroorotase  100 
 
 		 395 aa  801    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0386009 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2147  amidohydrolase  70.18 
 
 		 383 aa  552  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1082  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.81 
 
 		 377 aa  545  1e-154  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0950128 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1965  amidohydrolase  73.26 
 
 		 378 aa  532  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0906256  hitchhiker  0.000000000345538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0784  amidohydrolase  35.98 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.84947 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.41 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  32 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.97 
 
 		 418 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.34 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.97 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1675  amidohydrolase  32.87 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.717756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  36.13 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.85 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  32.41 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  31.28 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  29.53 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  29.53 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  31.41 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  31.26 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.53 
 
 		 420 aa  146  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1961  dihydroorotase  31.15 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  31.45 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  29.5 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  30.81 
 
 		 446 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  31.03 
 
 		 446 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  31.51 
 
 		 445 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0660  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.13 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  31.69 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.39 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  30.33 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  31.78 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.1 
 
 		 457 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.38 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  32.72 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  33.86 
 
 		 431 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  30.63 
 
 		 441 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  30.83 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  30.59 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.85 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  32.48 
 
 		 453 aa  136  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 436 aa  137  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  32.37 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  31 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  30.51 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  31.66 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.46 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.67 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.13 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  32.55 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  27.71 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  29.1 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.37 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  30.29 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  29.06 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  30.29 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  33.16 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  31.67 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  31.3 
 
 		 428 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.81 
 
 		 431 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  28.82 
 
 		 439 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  28.75 
 
 		 437 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  30.03 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  28.75 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.42 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  31.63 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  30.08 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  29.56 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  29.41 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  28.18 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  29.95 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.87 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  29.77 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  29.77 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  29.77 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  28.43 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  29.77 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.87 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  29.77 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  30.73 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  29.77 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.32 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  28.61 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  30 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.28 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  30.24 
 
 		 465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  31.88 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  27.25 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  31.01 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  31.88 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  31.88 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  31.54 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.83 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  26.23 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  28.35 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.52 
 
 		 456 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.52 
 
 		 456 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.54 
 
 		 447 aa  126  7e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  28.35 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.76 
 
 		 436 aa  126  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.15 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>