More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3984 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 202 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  66.13 
 
 		 186 aa  275  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.54 
 
 		 205 aa  255  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.78 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  44.83 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.83 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  42.5 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 		 208 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  43 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  43.06 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.5 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.16 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  40.95 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  43.56 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.29 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.85 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.32 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  41.9 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  40 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.38 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  39.71 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  40.62 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  39.8 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  40.2 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.72 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.19 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.36 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  37.32 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  37.25 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  41.46 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.36 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  37.81 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  35.68 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.27 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  37.86 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.38 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.07 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  32.04 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.97 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  31.55 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.44 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.13 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  31.84 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  29.95 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  25.37 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  30 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  29.5 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3548  glutathione S-transferase  26.85 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0628604  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  31.33 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  30.72 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.13 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  28.99 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  26.77 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6065  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  29.91 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  26.13 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.13 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  31.03 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  29.29 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  27.78 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.64 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  30.95 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  25.86 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  25.98 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.05 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3430  putative glutathione S-transferase  28.37 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2300  Glutathione S-transferase domain protein  28.02 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  27.05 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  26.63 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  27.27 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  27.18 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  27.78 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  29.08 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  41.05 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  29.08 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.86 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  25.63 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  29.08 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  29.08 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.63 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1119  putative glutathione S-transferase  29.08 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3410  putative glutathione S-transferase  29.08 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0257  putative glutathione S-transferase  29.08 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.02 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>