More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2281 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2281  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
542 aa  1041    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.454821  normal  0.480352 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2054  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  62.19 
 
 
543 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0322  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  56.16 
 
 
538 aa  465  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600588  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1799  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  59.08 
 
 
538 aa  444  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.928165 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0653  NADH dehydrogenase (quinone)  32.34 
 
 
611 aa  162  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  31.45 
 
 
617 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0386908  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0651  NADH dehydrogenase (quinone)  32.07 
 
 
616 aa  146  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.415661  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  35.03 
 
 
657 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000385592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1305  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.5 
 
 
1128 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0520  NADH dehydrogenase (quinone)  35.5 
 
 
620 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2653  NADH dehydrogenase (quinone)  34.55 
 
 
632 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.13 
 
 
625 aa  113  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  29.91 
 
 
633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  32.47 
 
 
642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.06 
 
 
636 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1087  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35 
 
 
691 aa  111  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1902  NADH dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 
1152 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165011  normal  0.0801476 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.46 
 
 
765 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.7 
 
 
639 aa  109  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.87 
 
 
683 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0413  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.5 
 
 
676 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  32.6 
 
 
610 aa  107  8e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0778  ech hydrogenase subunit A  33.99 
 
 
648 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00297843  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.55 
 
 
649 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13350  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  35.42 
 
 
939 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0152  ech hydrogenase subunit A  34.46 
 
 
639 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32 
 
 
654 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  31.77 
 
 
792 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.14 
 
 
639 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.14 
 
 
639 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.14 
 
 
639 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0595  NADH dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 
640 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.67 
 
 
654 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  31.21 
 
 
692 aa  104  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000361477 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.42 
 
 
957 aa  103  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  30.71 
 
 
596 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1919  NADH dehydrogenase subunit L  28.8 
 
 
596 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0146018  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.37 
 
 
639 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  34.64 
 
 
948 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  30.22 
 
 
634 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  30.71 
 
 
596 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1082  NADH dehydrogenase (quinone)  32.33 
 
 
624 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.047689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3531  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.31 
 
 
827 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247044  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0441  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.72 
 
 
676 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.592794  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0167  NADH-quinone oxidoreductase chain l  28.87 
 
 
603 aa  101  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07220  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  33.24 
 
 
643 aa  101  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000172038  normal  0.975039 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1570  NADH dehydrogenase (quinone)  32.86 
 
 
639 aa  101  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.161929 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0094  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.32 
 
 
765 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.85 
 
 
726 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  27.89 
 
 
636 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.75 
 
 
676 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  30.16 
 
 
638 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1098  NADH dehydrogenase (quinone)  35.53 
 
 
653 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.132295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1741  NADH dehydrogenase (quinone)  33.95 
 
 
624 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.449294  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.24 
 
 
627 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.43 
 
 
769 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0860  hydrogenase, EchA subunit, putative  34.35 
 
 
648 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  28.87 
 
 
642 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1434  NADH dehydrogenase subunit L  31.14 
 
 
600 aa  99.4  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_763  hydrogenase, EchA subunit  49.24 
 
 
648 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.675229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.85 
 
 
725 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.540916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.11 
 
 
782 aa  98.2  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.32 
 
 
933 aa  98.2  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.35 
 
 
631 aa  98.2  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  30.74 
 
 
793 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  29.19 
 
 
638 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.2 
 
 
659 aa  97.4  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  30.71 
 
 
889 aa  97.4  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  31.54 
 
 
624 aa  97.1  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  31.64 
 
 
662 aa  97.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.58 
 
 
643 aa  97.1  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0977  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.93 
 
 
767 aa  97.1  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.878835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.12 
 
 
790 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.91 
 
 
932 aa  96.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.49 
 
 
953 aa  96.3  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.31 
 
 
625 aa  96.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1433  NADH dehydrogenase (quinone)  34.99 
 
 
906 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.548118  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  29.1 
 
 
664 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.02 
 
 
911 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.26 
 
 
649 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.64 
 
 
666 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3024  ech hydrogenase subunit A  30.23 
 
 
636 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000133717  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  32.2 
 
 
891 aa  95.9  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0531  NADH dehydrogenase subunit L  28.09 
 
 
643 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1272  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.31 
 
 
608 aa  95.9  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.94 
 
 
931 aa  95.1  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0024  NADH dehydrogenase (quinone)  43.45 
 
 
635 aa  94.7  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.85 
 
 
642 aa  94.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.06 
 
 
642 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1366  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.92 
 
 
712 aa  94.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.699081  normal  0.0261424 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  31.1 
 
 
624 aa  94  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2501  NADH dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 
648 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1624  ech hydrogenase subunit A  33.33 
 
 
663 aa  94  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0985  NADH dehydrogenase subunit L  30.65 
 
 
643 aa  93.6  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.13 
 
 
930 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.54 
 
 
781 aa  93.6  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.86 
 
 
933 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  31.58 
 
 
611 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0214  NADH dehydrogenase I chain L  33.92 
 
 
616 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  32 
 
 
613 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>