More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2000 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 314 aa  638    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  73.87 
 
 		 341 aa  478  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  67.43 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  64.33 
 
 		 313 aa  412  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2084  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305359  normal  0.763617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0104  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  24.84 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  27.9 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  26.2 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 122 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  40.78 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 		 175 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3496  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.74 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  39 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 161 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 126 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 163 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  32.52 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  32 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.83 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  39.08 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  38.83 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 136 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 122 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  35.59 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  33.05 
 
 		 120 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 120 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1622  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  34.38 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.71 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.85 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  32.26 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  29.76 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.85 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  34.38 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  31.85 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.85 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.61 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  30.89 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  39.08 
 
 		 161 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  30.32 
 
 		 170 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  36.52 
 
 		 143 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  39.08 
 
 		 161 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 145 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  30.89 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>