More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1872 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  100 
 
 
296 aa  596  1e-169  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  73.04 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  72.64 
 
 
296 aa  449  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  72.01 
 
 
297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  44.38 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  37.92 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  36.76 
 
 
324 aa  162  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  36.36 
 
 
308 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  36.86 
 
 
320 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  35.47 
 
 
326 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  33.43 
 
 
339 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  31.94 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  31.94 
 
 
323 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  34.08 
 
 
325 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  32.69 
 
 
323 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  32.88 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.92 
 
 
315 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.92 
 
 
315 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.59 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  32.26 
 
 
316 aa  123  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  33.12 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  29.45 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  29.89 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  34.21 
 
 
308 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  32.46 
 
 
357 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.16 
 
 
315 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.28 
 
 
322 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  29.82 
 
 
266 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  29.17 
 
 
321 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  30.74 
 
 
324 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.53 
 
 
313 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  28.76 
 
 
313 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  29.14 
 
 
393 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.64 
 
 
302 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.32 
 
 
352 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.16 
 
 
317 aa  102  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  33.75 
 
 
313 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  27.68 
 
 
306 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.78 
 
 
305 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  30.53 
 
 
318 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  30.22 
 
 
330 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  29.65 
 
 
323 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  33.73 
 
 
290 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.86 
 
 
300 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  33.73 
 
 
290 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  31.39 
 
 
308 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  33.73 
 
 
290 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.95 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.41 
 
 
391 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  32.28 
 
 
361 aa  99.4  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  30.13 
 
 
316 aa  99  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.3 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  31.15 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  30.07 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  30.84 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  32.06 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  33.75 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  30.72 
 
 
314 aa  95.9  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  30.72 
 
 
314 aa  95.9  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.43 
 
 
409 aa  95.9  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  27.13 
 
 
478 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  30.04 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  31.01 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  32.08 
 
 
420 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  28.19 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  29.75 
 
 
315 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0014  ROK family protein  28.37 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  30.16 
 
 
306 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.77 
 
 
396 aa  93.6  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.39 
 
 
398 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  28.13 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  32.79 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.26 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  30.82 
 
 
292 aa  92.8  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  29.41 
 
 
335 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  31.4 
 
 
336 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.59 
 
 
385 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  33.86 
 
 
319 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  27.67 
 
 
325 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  32.62 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  28.71 
 
 
393 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  32.62 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  29.65 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  30.4 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.9 
 
 
302 aa  89.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.2 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  25.67 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  32.48 
 
 
312 aa  89  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.55 
 
 
317 aa  89  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  33.02 
 
 
320 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  27.8 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  32.81 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  27.81 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.52 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  31.6 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  26.92 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  26.01 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.05 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  31.17 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>