225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1163 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  74.58 
 
 		 434 aa  683    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  100 
 
 		 433 aa  910    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  54.08 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  53.77 
 
 		 453 aa  519  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  53.77 
 
 		 454 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  52.11 
 
 		 448 aa  508  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  54.24 
 
 		 458 aa  501  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  50.81 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  52 
 
 		 433 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  52.31 
 
 		 445 aa  495  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  53.43 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  55 
 
 		 461 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 455 aa  494  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  51.76 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  52.05 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  49.54 
 
 		 442 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  49.54 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  50.47 
 
 		 432 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  46.21 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  48.91 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  48.66 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  45.82 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  46.21 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  44.6 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  42.62 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  34.13 
 
 		 493 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  33.9 
 
 		 555 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  27.61 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  28.96 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.91 
 
 		 365 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.78 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.43 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.18 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.49 
 
 		 392 aa  163  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.25 
 
 		 386 aa  160  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  27.36 
 
 		 368 aa  156  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  27.49 
 
 		 407 aa  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  25.18 
 
 		 384 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.86 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.65 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  30.13 
 
 		 527 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.39 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  29.17 
 
 		 356 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.96 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30 
 
 		 348 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  31.47 
 
 		 338 aa  106  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.09 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.97 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.68 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.75 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5091  hypothetical protein  28.26 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5769  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.26 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  29.31 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.44 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.32 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.02 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.64 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1455  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.25 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237279  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.39 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.38 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.34 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.38 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  28.95 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.51 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  26.64 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.39 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.75 
 
 		 344 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  28.51 
 
 		 342 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.2 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  28.51 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  29.75 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.64 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  28.02 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  28.46 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1288  L-lysine 2,3-aminomutase  29.58 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0875107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  30.29 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.82 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  26.75 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  29.34 
 
 		 349 aa  98.2  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  29.34 
 
 		 342 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.45 
 
 		 365 aa  98.2  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.93 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28 
 
 		 356 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  29.95 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  29.17 
 
 		 342 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.08 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  29.17 
 
 		 342 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  29.75 
 
 		 342 aa  97.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.87 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2783  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.72 
 
 		 355 aa  96.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.2 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.21 
 
 		 363 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.26 
 
 		 437 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.2 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  27.51 
 
 		 366 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.33 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  24.67 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  24.45 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.38 
 
 		 358 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
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