More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0673 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0776  tryptophan synthase subunit beta  79.7 
 
 		 400 aa  680    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  78.2 
 
 		 399 aa  661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0535  tryptophan synthase subunit beta  74.69 
 
 		 399 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000244592  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  78.93 
 
 		 399 aa  657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  78.2 
 
 		 399 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  75.44 
 
 		 399 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0673  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 400 aa  832    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  64.96 
 
 		 402 aa  529  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  63.82 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  60.93 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 399 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 399 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 399 aa  497  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 399 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 399 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  59.64 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 394 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  60.67 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  60.4 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 405 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 413 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  59.65 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 394 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.67 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 435 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 400 aa  484  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 412 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  62.02 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 422 aa  484  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.67 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 434 aa  481  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 411 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 406 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 410 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 		 407 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 396 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 406 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1024  tryptophan synthase subunit beta  59.16 
 
 		 414 aa  480  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204551  hitchhiker  0.00011605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  59.07 
 
 		 402 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 402 aa  481  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4868  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 398 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  58.63 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 401 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 405 aa  477  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  57.89 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 414 aa  478  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>