108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06187 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  66.67 
 
 
213 aa  261  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.87 
 
 
233 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  29.44 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  32.73 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  29.44 
 
 
300 aa  79  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  26.96 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  24.03 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  25.81 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  28 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  26.97 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  26 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  27.54 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  24.03 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  30.86 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  27.54 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  30.43 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  21.74 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  27.54 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  25.66 
 
 
316 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  24.84 
 
 
318 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  21.74 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  26.97 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  28.93 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  29.17 
 
 
268 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  25 
 
 
316 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  22.61 
 
 
266 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  23.86 
 
 
338 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  23.35 
 
 
338 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  29.12 
 
 
307 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 
254 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  34.36 
 
 
262 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  23.35 
 
 
338 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  23.35 
 
 
338 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  25 
 
 
268 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  23.6 
 
 
267 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  24.69 
 
 
403 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  22.03 
 
 
316 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  24.84 
 
 
266 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  25.3 
 
 
266 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  25.47 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0055  flagellar protein FliH  36.3 
 
 
274 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  21.52 
 
 
262 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  24.55 
 
 
272 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  29.41 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  26.35 
 
 
268 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  28.97 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  30 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  22.73 
 
 
266 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  26.61 
 
 
268 aa  55.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  28.5 
 
 
244 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1690  hypothetical protein  34.48 
 
 
271 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000583749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  28.28 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  28.97 
 
 
227 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  23.95 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  22.54 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.46 
 
 
260 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  28.97 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  28.97 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  26.79 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  27.59 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  32.14 
 
 
245 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  28.5 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  25.3 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  26.62 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  29.86 
 
 
226 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  29.86 
 
 
226 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  29.86 
 
 
226 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  29.86 
 
 
226 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  29.86 
 
 
226 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  25.6 
 
 
227 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  29.86 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  27.74 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  26.95 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  26.35 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  26.35 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  23.53 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  24.69 
 
 
241 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  29.94 
 
 
230 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  24.69 
 
 
240 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  21.71 
 
 
276 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1643  hypothetical protein  34.25 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0152574  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  24.29 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  28.97 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  28.97 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  23.95 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.14 
 
 
231 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  23.6 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  22.16 
 
 
349 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  22.52 
 
 
290 aa  45.1  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  25.31 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  26.63 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  30.41 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  24.35 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  29.73 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>