16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1643 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0152574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0055  flagellar protein FliH  60.31 
 
 		 274 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1690  hypothetical protein  60.69 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000583749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  33.56 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  34.23 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  34.23 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  24.14 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  24.83 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  23.45 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  30.77 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  32.85 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  30.07 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  22.97 
 
 		 334 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  29.57 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  28.17 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>