More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04267 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  100 
 
 		 151 aa  312  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  88 
 
 		 150 aa  281  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  68.09 
 
 		 146 aa  207  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.86 
 
 		 154 aa  206  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  67.86 
 
 		 154 aa  206  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.86 
 
 		 154 aa  206  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.1 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  65.07 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.11 
 
 		 158 aa  169  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.38 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  48.94 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.06 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.71 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.71 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.23 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.71 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.03 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  50.35 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.64 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  48.25 
 
 		 177 aa  142  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.29 
 
 		 274 aa  141  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.35 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.59 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  51.52 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  46.15 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  45.14 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  50.72 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  45.64 
 
 		 175 aa  134  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  45.83 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.59 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  47.18 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  46.15 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  46.15 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  46.15 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  46.15 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 		 145 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  46.15 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.15 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  46.85 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  45.45 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  46.15 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  46.15 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  45.45 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  48.59 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  47.68 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  44.37 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  42.96 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  43.06 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  48.57 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  44.68 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  43.15 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  42.95 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.05 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.87 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.95 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  34.56 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  33.33 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.99 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.54 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  31.79 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.89 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.79 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  36.27 
 
 		 182 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  35.2 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  35.2 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  32.06 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.94 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.64 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0169  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.11 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  31.25 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  31.25 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  31.25 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  30.2 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.91 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  31.25 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.96 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.56 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  31.25 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  33.68 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.07 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.1 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.69 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.24 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.99 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30.88 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  30.88 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  30.88 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  30.88 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  30.88 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1208  tRNA-adenosine deaminase  35.16 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.755847 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  30.88 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.86 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>