53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02230 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  53.72 
 
 		 189 aa  224  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  53.19 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  54.35 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  31.82 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  29.19 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  28.26 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  32.24 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  27.72 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  28.19 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  27.17 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  27.17 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  26.97 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  26.78 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  28.26 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  24.73 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  26.63 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  27.61 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  26.09 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  27.33 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  28.03 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  33.64 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  30.89 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  28.75 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  28.66 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  23.87 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  28.37 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  29.77 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0975  hypothetical protein  23.4 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  24.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  24.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  26.29 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  24.59 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  23.57 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  26.86 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  32.06 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  32.06 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  25 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  25.53 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0367  protein of unknown function DUF1239  26.15 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  22.99 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  28.79 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  22.92 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  27.06 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  23.94 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>