More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00986 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_06180  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  100 
 
 
377 aa  793    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0160226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00986  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  100 
 
 
377 aa  793    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0610  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.21 
 
 
381 aa  617  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2646  Rieske (2Fe-2S) region  74.27 
 
 
381 aa  614  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.484133  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4282  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.29 
 
 
399 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.64 
 
 
369 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3114  Rieske (2Fe-2S) region  28.61 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2807  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.12 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3035  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.07 
 
 
382 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.416925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.01 
 
 
384 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  26.18 
 
 
380 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  25.79 
 
 
373 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  31.25 
 
 
429 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  31.25 
 
 
429 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.64 
 
 
377 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  31.71 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  32.35 
 
 
387 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.09 
 
 
440 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.03 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  27.09 
 
 
424 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.63 
 
 
427 aa  97.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
383 aa  96.3  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.93 
 
 
362 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  27.18 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.18 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.18 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  27.18 
 
 
374 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.18 
 
 
374 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  28.57 
 
 
410 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.18 
 
 
374 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  27.18 
 
 
374 aa  94  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.18 
 
 
374 aa  94  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  27.18 
 
 
374 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.81 
 
 
487 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  28.12 
 
 
432 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.05 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.4 
 
 
430 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  30.1 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.74 
 
 
420 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.36 
 
 
362 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.81 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.23 
 
 
430 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  28.46 
 
 
445 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.84 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  29.36 
 
 
434 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.67 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  25.63 
 
 
447 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2679  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.43 
 
 
437 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.68 
 
 
430 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.18 
 
 
430 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  30.48 
 
 
431 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  29.23 
 
 
455 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.23 
 
 
455 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.46 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.46 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.23 
 
 
455 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.46 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.8 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.79 
 
 
430 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  27.68 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  27.5 
 
 
387 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  24.6 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.33 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.23 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.15 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.11 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  25.9 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.22 
 
 
431 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.22 
 
 
436 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.92 
 
 
452 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.04 
 
 
492 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.08 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  29.06 
 
 
387 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.47 
 
 
358 aa  87  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.07 
 
 
429 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.3 
 
 
413 aa  87  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1189  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.17 
 
 
450 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  27.36 
 
 
395 aa  86.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 
423 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.46 
 
 
360 aa  86.3  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2439  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.8 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  26.79 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.8 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2770  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0200185  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.14 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.47 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.84 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  26.23 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.6 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58359  predicted protein  26.7 
 
 
218 aa  84  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00818873  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.5 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.67 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  28.91 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.91 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.91 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.44 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>