More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4437 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
350 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  96 
 
 
350 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  84 
 
 
350 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  82.76 
 
 
348 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  82.76 
 
 
348 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  82.76 
 
 
348 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  82.18 
 
 
348 aa  587  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  79.14 
 
 
350 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  78.1 
 
 
351 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  77.81 
 
 
351 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  75.29 
 
 
351 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  65.43 
 
 
353 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  65.82 
 
 
356 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  65.24 
 
 
354 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  64.86 
 
 
357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  63.4 
 
 
357 aa  461  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  62.25 
 
 
369 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  63.71 
 
 
356 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  63.84 
 
 
357 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  61.14 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 
356 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  60.06 
 
 
355 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 
353 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 
355 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  61.19 
 
 
370 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  58.86 
 
 
353 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  58.36 
 
 
355 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  57.79 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  61.74 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  59.21 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  57.51 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  57.51 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  58.64 
 
 
359 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 
355 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  57.79 
 
 
355 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  59.71 
 
 
351 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  56.94 
 
 
371 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  56.94 
 
 
355 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 
355 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  59.54 
 
 
362 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 
356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  56.94 
 
 
357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  56.94 
 
 
357 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  56.94 
 
 
357 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  56.94 
 
 
357 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  56.02 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  55.77 
 
 
367 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  52.57 
 
 
353 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  54 
 
 
351 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  54 
 
 
355 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  52.97 
 
 
353 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  53.35 
 
 
377 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  48.57 
 
 
355 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  52.23 
 
 
377 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  45.71 
 
 
355 aa  341  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  45.22 
 
 
356 aa  335  5.999999999999999e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  44.16 
 
 
354 aa  332  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  45.38 
 
 
349 aa  319  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  42.41 
 
 
356 aa  290  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  41.72 
 
 
350 aa  279  4e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  38.57 
 
 
350 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  38.26 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 
350 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  37.87 
 
 
348 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.87 
 
 
348 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
358 aa  219  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  35.84 
 
 
350 aa  215  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  36.15 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  34.68 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  34.09 
 
 
350 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  38.53 
 
 
364 aa  208  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  36.2 
 
 
354 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
365 aa  203  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  35.75 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
371 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  36.66 
 
 
381 aa  175  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 
371 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
373 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  31.55 
 
 
364 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.64 
 
 
358 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
370 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  31.62 
 
 
370 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 
369 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
362 aa  166  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  31.11 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  31.11 
 
 
365 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 
358 aa  165  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
385 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 
383 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  36.1 
 
 
356 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>