268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4394 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
306 aa  617  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  83.66 
 
 
306 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  69.93 
 
 
305 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  65.69 
 
 
305 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  65.68 
 
 
305 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  65.03 
 
 
305 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  65.03 
 
 
305 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  65.13 
 
 
303 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  63.79 
 
 
303 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  63.12 
 
 
303 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  61.67 
 
 
297 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  34.04 
 
 
296 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  34.86 
 
 
326 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  34.8 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  34.84 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  35.23 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  34.42 
 
 
311 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 
312 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  35.27 
 
 
327 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  35.44 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  31.67 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  35.24 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  29.83 
 
 
294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  34.01 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
303 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
303 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
303 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
303 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  33.62 
 
 
322 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  35.11 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  32.52 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  32.17 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  35.67 
 
 
303 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 
303 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 
303 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 
303 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 
303 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 
302 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  32.99 
 
 
306 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  29.21 
 
 
289 aa  110  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 
309 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 
302 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 
313 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  26.04 
 
 
315 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 
300 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  24.92 
 
 
357 aa  96.7  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
312 aa  96.3  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 
310 aa  89.4  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  28.05 
 
 
424 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  32.84 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  31.92 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  28.19 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  24.35 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  34.27 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  25.43 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  22.53 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  30.04 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  21.84 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  22.79 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  28.7 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  24.16 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  25.42 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  23.88 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  23.88 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>