80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4903 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  36.31 
 
 
423 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  35.73 
 
 
423 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  35.16 
 
 
429 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  35.51 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  35.45 
 
 
423 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  34.01 
 
 
425 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  35.45 
 
 
423 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  35.73 
 
 
423 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  36.21 
 
 
442 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  36.21 
 
 
442 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  36.21 
 
 
441 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  36.21 
 
 
442 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  36.21 
 
 
442 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  36.21 
 
 
432 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  34.92 
 
 
419 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  34.64 
 
 
418 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  34.77 
 
 
423 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  36.02 
 
 
312 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  36.26 
 
 
311 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  38.11 
 
 
308 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  35.77 
 
 
298 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  35.18 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  37.39 
 
 
304 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  36.59 
 
 
279 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  33.33 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  26.48 
 
 
351 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  26.36 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  28.74 
 
 
331 aa  92.8  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  25.82 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  29.83 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  36.64 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  26.21 
 
 
436 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  35.07 
 
 
276 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.58 
 
 
719 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  29.41 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  26.09 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  25.47 
 
 
287 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  34.21 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  30.94 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.73 
 
 
634 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.67 
 
 
651 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.33 
 
 
669 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  28.95 
 
 
295 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.67 
 
 
653 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  33.08 
 
 
303 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  28.95 
 
 
295 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.16 
 
 
653 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  29.71 
 
 
442 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  24.66 
 
 
319 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.84 
 
 
609 aa  46.2  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  38.1 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  33.59 
 
 
580 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  38.1 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  23.08 
 
 
300 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.39 
 
 
697 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  26.47 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  23.51 
 
 
688 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  24.7 
 
 
273 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  25.94 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  33.04 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  34.91 
 
 
292 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  29.17 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  28.91 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.79 
 
 
642 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  22.77 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  28.47 
 
 
517 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.38 
 
 
656 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  25.42 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
297 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.53 
 
 
695 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  22.52 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.22 
 
 
412 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.05 
 
 
254 aa  43.1  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  27.82 
 
 
498 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.22 
 
 
412 aa  42.7  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.96 
 
 
518 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  30.66 
 
 
291 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.39 
 
 
685 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>