More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3841 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3841  putative amino acid permease  100 
 
 		 455 aa  890    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  80 
 
 		 454 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45240  putative amino acid permease  98.24 
 
 		 455 aa  870    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1685  amino acid transporter  55.34 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179988  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3736  amino acid permease-associated region  55.12 
 
 		 468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1651  amino acid permease  56.95 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4210  amino acid permease-associated region  55.34 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1020  amino acid permease  56.5 
 
 		 470 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1106  amino acid permease  56.5 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0591  amino acid permease  56.28 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1844  amino acid permease  56.28 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742156  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2325  amino acid permease  56.5 
 
 		 469 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3200  amino acid permease-associated region  56.21 
 
 		 468 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0877  amino acid permease  56.28 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4045  amino acid permease-associated region  56.21 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4289  amino acid permease-associated region  56.48 
 
 		 468 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4321  amino acid permease-associated region  56.21 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  33.25 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2010  amino acid permease-associated region  36.99 
 
 		 468 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1325  amino acid permease-associated region  33.25 
 
 		 464 aa  190  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0934  amino acid permease-associated region  31.06 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0763  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  22.43 
 
 		 500 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.4 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  23.59 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.27 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.27 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.27 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.27 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  21.95 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.27 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  22.41 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  22.41 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.8 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  22.25 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  21.98 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.05 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22.34 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  21.23 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  27.33 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  22.63 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  23.2 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  21.24 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  22.76 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  23.77 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  25.5 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  21.89 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  27.64 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  27.75 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  22.35 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  22.17 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  28.72 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.74 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  22.32 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  25.55 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  27.73 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.68 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 641 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  20.05 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  27.48 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  25.79 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  24.29 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  24.77 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>