73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3670 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.748354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43760  hypothetical protein  87.38 
 
 		 301 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0384  hypothetical protein  42.69 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.387534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2958  hypothetical protein  41.51 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2363  hypothetical protein  35.21 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02723  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  37.37 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1504  hypothetical protein  42.04 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400142  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1265  hypothetical protein  36.17 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000338125  hitchhiker  0.000790963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2386  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  40.08 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565719  hitchhiker  0.000735604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2879  hypothetical protein  37.41 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0257502  hitchhiker  0.00113729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1448  hypothetical protein  37.1 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1440  hypothetical protein  36.46 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3020  type IV pilus assembly protein PilM  41.15 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0040743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3117  hypothetical protein  38.03 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2938  hypothetical protein  40.74 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000623301  normal  0.325762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1141  hypothetical protein  39.11 
 
 		 359 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0266938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0067  hypothetical protein  33.21 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1081  hypothetical protein  39.11 
 
 		 357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1175  hypothetical protein  39.11 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00935505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3214  hypothetical protein  39.11 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00985541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3660  GGDEF  37.2 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0945  ribosomal protein L15  38.18 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1880  hypothetical protein  32.93 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.361492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2361  exonuclease  36.44 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13094  normal  0.909289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2849  hypothetical protein  39.04 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2658  Type IV pilus assembly protein PilM  32.75 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0554552  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0941  type IV pilus assembly protein PilM  37.35 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00121158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3028  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.88 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1423  hypothetical protein  35.85 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3704  hypothetical protein  36.44 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1309  type IV pilus assembly protein PilM  35.34 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.701757  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0793  hypothetical protein  35.56 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2298  hypothetical protein  33.08 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1439  flavodoxin, long chain  32.65 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2659  penicillin-binding protein 1A  30.39 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2546  hypothetical protein  35.57 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1745  hypothetical protein  33.9 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.043423  normal  0.315649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2264  hypothetical protein  33.47 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1702  hypothetical protein  31.37 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.594136  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6239  hypothetical protein  32.31 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0672  hypothetical protein  34.8 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0133452  hitchhiker  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3276  hypothetical protein  33.64 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000378061  hitchhiker  0.00588252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0099  hypothetical protein  30.69 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.238666  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6557  hypothetical protein  32.67 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3407  hypothetical protein  37.55 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1829  hypothetical protein  31.58 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3152  hypothetical protein  32.07 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1464  hypothetical protein  30.15 
 
 		 319 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3294  hypothetical protein  30.6 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1440  hypothetical protein  34.84 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0116  hypothetical protein  31.47 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00713  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  33.48 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3539  hypothetical protein  30.88 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4757  hypothetical protein  29.64 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0149  hypothetical protein  32.13 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2655  hypothetical protein  27.34 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1023  hypothetical protein  31.94 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3998  hypothetical protein  27.27 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0588  hypothetical protein  30.33 
 
 		 359 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.370107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3538  hypothetical protein  30.2 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2998  hypothetical protein  29.14 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2800  hypothetical protein  29 
 
 		 268 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.812024  hitchhiker  0.0000116766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1206  hypothetical protein  27.65 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0217675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3293  hypothetical protein  28.02 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4007  SMF protein  26.83 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1052  hypothetical protein  26.38 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3199  putative PAS/PAC sensor protein  24.78 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3510  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.44 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3230  hypothetical protein  25.12 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.27 
 
 		 862 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>