63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1206 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1206  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  544  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0217675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0067  hypothetical protein  24.82 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43760  hypothetical protein  27.72 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1265  hypothetical protein  26.97 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000338125  hitchhiker  0.000790963 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6557  hypothetical protein  29.76 
 
 		 310 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3670  hypothetical protein  29.05 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.748354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6239  hypothetical protein  30.2 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3117  hypothetical protein  28.19 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1439  flavodoxin, long chain  24.1 
 
 		 326 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3020  type IV pilus assembly protein PilM  29 
 
 		 328 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0040743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1423  hypothetical protein  27.96 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2938  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000623301  normal  0.325762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1141  hypothetical protein  28.14 
 
 		 359 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0266938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00713  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  28.51 
 
 		 306 aa  85.9  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1175  hypothetical protein  27.71 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00935505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3214  hypothetical protein  27.27 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00985541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2361  exonuclease  28.89 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13094  normal  0.909289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0941  type IV pilus assembly protein PilM  26.72 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00121158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0384  hypothetical protein  25.66 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.387534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2879  hypothetical protein  26.04 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0257502  hitchhiker  0.00113729 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2546  hypothetical protein  26.97 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2958  hypothetical protein  24.59 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3028  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.06 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1448  hypothetical protein  26.02 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1440  hypothetical protein  23.71 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1504  hypothetical protein  25.64 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400142  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1309  type IV pilus assembly protein PilM  27.8 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.701757  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4757  hypothetical protein  25.79 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1880  hypothetical protein  26.14 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.361492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2298  hypothetical protein  25.31 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3152  hypothetical protein  26.07 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3704  hypothetical protein  25.64 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02723  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  23.14 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2658  Type IV pilus assembly protein PilM  23.95 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0554552  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0945  ribosomal protein L15  24.55 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0793  hypothetical protein  26.94 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2264  hypothetical protein  27.62 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0099  hypothetical protein  26.64 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.238666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2363  hypothetical protein  22.85 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2659  penicillin-binding protein 1A  23.81 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1440  hypothetical protein  25.96 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3276  hypothetical protein  26.82 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000378061  hitchhiker  0.00588252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2849  hypothetical protein  24.75 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1829  hypothetical protein  24.37 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2386  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  25 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565719  hitchhiker  0.000735604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1023  hypothetical protein  28.65 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3660  GGDEF  22.85 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1702  hypothetical protein  23.17 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.594136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3407  hypothetical protein  26.61 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0116  hypothetical protein  23.89 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2084  hypothetical protein  27.11 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0149  hypothetical protein  24.9 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2998  hypothetical protein  24.29 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3998  hypothetical protein  20 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1745  hypothetical protein  22.78 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.043423  normal  0.315649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4007  SMF protein  19.57 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1464  hypothetical protein  22.58 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0672  hypothetical protein  21.43 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0133452  hitchhiker  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2800  hypothetical protein  21.03 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.812024  hitchhiker  0.0000116766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3539  hypothetical protein  21.93 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2655  hypothetical protein  23.5 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3538  hypothetical protein  21.5 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>