69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0149 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0149  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  603  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0099  hypothetical protein  46.67 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.238666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0116  hypothetical protein  48.22 
 
 
347 aa  271  7e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4757  hypothetical protein  43.8 
 
 
295 aa  252  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1423  hypothetical protein  30.8 
 
 
297 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2546  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3276  hypothetical protein  30.43 
 
 
283 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000378061  hitchhiker  0.00588252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02723  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  37.75 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0945  ribosomal protein L15  33.8 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000657497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3214  hypothetical protein  34.36 
 
 
353 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00985541  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1265  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000338125  hitchhiker  0.000790963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0793  hypothetical protein  26.27 
 
 
289 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2938  hypothetical protein  31.97 
 
 
328 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000623301  normal  0.325762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3020  type IV pilus assembly protein PilM  34.43 
 
 
328 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0040743  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3152  hypothetical protein  31.1 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2658  Type IV pilus assembly protein PilM  33.8 
 
 
288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0554552  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1081  hypothetical protein  34.36 
 
 
357 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3660  GGDEF  28.52 
 
 
293 aa  135  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3117  hypothetical protein  34.8 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000955559  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0067  hypothetical protein  31.47 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1175  hypothetical protein  34.51 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00935505  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1141  hypothetical protein  33.48 
 
 
359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0266938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2361  exonuclease  29.25 
 
 
285 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13094  normal  0.909289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2879  hypothetical protein  29.76 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0257502  hitchhiker  0.00113729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0672  hypothetical protein  31.34 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0133452  hitchhiker  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2998  hypothetical protein  28.62 
 
 
318 aa  126  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3407  hypothetical protein  29.23 
 
 
297 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0941  type IV pilus assembly protein PilM  32.6 
 
 
287 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00121158  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2298  hypothetical protein  26.88 
 
 
294 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2363  hypothetical protein  30.8 
 
 
288 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2849  hypothetical protein  28.74 
 
 
292 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535348  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2659  penicillin-binding protein 1A  28.38 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209097  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1309  type IV pilus assembly protein PilM  30.97 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.701757  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2958  hypothetical protein  29.92 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1448  hypothetical protein  28.17 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3028  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.95 
 
 
332 aa  118  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1829  hypothetical protein  28.63 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1440  hypothetical protein  33.2 
 
 
304 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0384  hypothetical protein  28.68 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.387534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1440  hypothetical protein  30.94 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1504  hypothetical protein  30.1 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400142  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1880  hypothetical protein  23.84 
 
 
319 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.361492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2386  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  30.7 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565719  hitchhiker  0.000735604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43760  hypothetical protein  31.03 
 
 
301 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3670  hypothetical protein  32.13 
 
 
301 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.748354  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2264  hypothetical protein  28.63 
 
 
314 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1439  flavodoxin, long chain  30.13 
 
 
326 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00713  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  28.77 
 
 
306 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3539  hypothetical protein  28.36 
 
 
295 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3704  hypothetical protein  28.4 
 
 
301 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3538  hypothetical protein  27.31 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1702  hypothetical protein  24.6 
 
 
295 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.594136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1745  hypothetical protein  25.67 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.043423  normal  0.315649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2800  hypothetical protein  26.05 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.812024  hitchhiker  0.0000116766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6239  hypothetical protein  26.15 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1464  hypothetical protein  25 
 
 
319 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6557  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3294  hypothetical protein  30.33 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2084  hypothetical protein  28.11 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4007  SMF protein  26.81 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1023  hypothetical protein  30.05 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3998  hypothetical protein  25.65 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0588  hypothetical protein  25.5 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.370107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2655  hypothetical protein  23.2 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3199  putative PAS/PAC sensor protein  24.59 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3293  hypothetical protein  26.24 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1052  hypothetical protein  20.42 
 
 
333 aa  58.9  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1206  hypothetical protein  24.9 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0217675  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.75 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>