69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2361 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2361  exonuclease  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13094  normal  0.909289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3276  hypothetical protein  54.32 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000378061  hitchhiker  0.00588252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2879  hypothetical protein  48.75 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0257502  hitchhiker  0.00113729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2658  Type IV pilus assembly protein PilM  43.22 
 
 		 288 aa  251  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0554552  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2659  penicillin-binding protein 1A  43.96 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1265  hypothetical protein  39.85 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000338125  hitchhiker  0.000790963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1440  hypothetical protein  39.04 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0945  ribosomal protein L15  38.01 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2386  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  36.88 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565719  hitchhiker  0.000735604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1504  hypothetical protein  40.93 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400142  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1439  flavodoxin, long chain  37.9 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3660  GGDEF  33.81 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2849  hypothetical protein  34.2 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0384  hypothetical protein  38.78 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.387534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1448  hypothetical protein  41.9 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1423  hypothetical protein  37.65 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2546  hypothetical protein  33.45 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3020  type IV pilus assembly protein PilM  36.68 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0040743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2938  hypothetical protein  36.29 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000623301  normal  0.325762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3117  hypothetical protein  36.65 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3214  hypothetical protein  36.67 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00985541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1141  hypothetical protein  36.67 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0266938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1081  hypothetical protein  36.25 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1175  hypothetical protein  36.67 
 
 		 355 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00935505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43760  hypothetical protein  38.46 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0941  type IV pilus assembly protein PilM  34.71 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00121158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2298  hypothetical protein  33.57 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1309  type IV pilus assembly protein PilM  34.33 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.701757  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0793  hypothetical protein  36.18 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3670  hypothetical protein  36.44 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.748354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2958  hypothetical protein  38.81 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2363  hypothetical protein  32.63 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1880  hypothetical protein  32.5 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.361492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3152  hypothetical protein  31.52 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0672  hypothetical protein  35.38 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0133452  hitchhiker  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1829  hypothetical protein  31.69 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02723  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  34.66 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6557  hypothetical protein  33.62 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0067  hypothetical protein  34.27 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836373  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3704  hypothetical protein  32.93 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0149  hypothetical protein  28.67 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3539  hypothetical protein  30.91 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3028  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1464  hypothetical protein  31.95 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1745  hypothetical protein  31.95 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.043423  normal  0.315649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0116  hypothetical protein  30.98 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0099  hypothetical protein  25.18 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.238666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1702  hypothetical protein  34.17 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.594136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1440  hypothetical protein  30.8 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4757  hypothetical protein  29.86 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00713  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  30.16 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3407  hypothetical protein  29.69 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3294  hypothetical protein  30.95 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1023  hypothetical protein  30.93 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2655  hypothetical protein  30.43 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3998  hypothetical protein  28.41 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3538  hypothetical protein  31.09 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2998  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2800  hypothetical protein  27.98 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.812024  hitchhiker  0.0000116766 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2084  hypothetical protein  31.65 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1206  hypothetical protein  28.89 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0217675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4007  SMF protein  26.62 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3293  hypothetical protein  28.93 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0588  hypothetical protein  28.8 
 
 		 359 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.370107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1052  hypothetical protein  24.71 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3510  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  28.09 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3199  putative PAS/PAC sensor protein  29.66 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>