71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1504 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1504  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400142  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1448  hypothetical protein  52.88 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1440  hypothetical protein  44.56 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1439  flavodoxin, long chain  45.17 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2849  hypothetical protein  45.34 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2386  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  42.46 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565719  hitchhiker  0.000735604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3660  GGDEF  39.84 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2879  hypothetical protein  37.84 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0257502  hitchhiker  0.00113729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1265  hypothetical protein  40.74 
 
 		 291 aa  201  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000338125  hitchhiker  0.000790963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3670  hypothetical protein  42.04 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.748354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2361  exonuclease  40.93 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13094  normal  0.909289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2658  Type IV pilus assembly protein PilM  38.91 
 
 		 288 aa  179  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0554552  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43760  hypothetical protein  40.82 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1141  hypothetical protein  38.02 
 
 		 359 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0266938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3214  hypothetical protein  37.6 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00985541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1175  hypothetical protein  38.02 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00935505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2659  penicillin-binding protein 1A  38.11 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1081  hypothetical protein  38.43 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0945  ribosomal protein L15  36.69 
 
 		 288 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0384  hypothetical protein  39.18 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.387534  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3020  type IV pilus assembly protein PilM  34.35 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0040743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2938  hypothetical protein  34.12 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000623301  normal  0.325762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2546  hypothetical protein  34.21 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3117  hypothetical protein  37.5 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1309  type IV pilus assembly protein PilM  38.84 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.701757  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02723  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  36.39 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3276  hypothetical protein  36.67 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000378061  hitchhiker  0.00588252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1423  hypothetical protein  34.67 
 
 		 297 aa  165  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3152  hypothetical protein  34.75 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2958  hypothetical protein  35.82 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0941  type IV pilus assembly protein PilM  35.48 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00121158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1880  hypothetical protein  37.1 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.361492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0793  hypothetical protein  36.57 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2298  hypothetical protein  33.47 
 
 		 294 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2363  hypothetical protein  34.94 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0067  hypothetical protein  37.07 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836373  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6557  hypothetical protein  32.32 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0099  hypothetical protein  33.03 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.238666  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6239  hypothetical protein  32.19 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3028  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.86 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3704  hypothetical protein  38.36 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0672  hypothetical protein  33.99 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0133452  hitchhiker  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4757  hypothetical protein  32.13 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3407  hypothetical protein  35.02 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1829  hypothetical protein  32.97 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1745  hypothetical protein  30.96 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.043423  normal  0.315649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1464  hypothetical protein  32.08 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1702  hypothetical protein  30.54 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.594136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1440  hypothetical protein  39.79 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399885  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2264  hypothetical protein  33.2 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0116  hypothetical protein  29.27 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2998  hypothetical protein  32.86 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0149  hypothetical protein  27.08 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2800  hypothetical protein  32.86 
 
 		 268 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.812024  hitchhiker  0.0000116766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3538  hypothetical protein  34.18 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2655  hypothetical protein  31.12 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1023  hypothetical protein  35.23 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3539  hypothetical protein  30.21 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3294  hypothetical protein  31.46 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00713  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  30.94 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2084  hypothetical protein  31.28 
 
 		 329 aa  92.8  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0588  hypothetical protein  26.48 
 
 		 359 aa  92.4  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.370107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3998  hypothetical protein  29.61 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3293  hypothetical protein  35.92 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4007  SMF protein  29.03 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1052  hypothetical protein  27.17 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1206  hypothetical protein  25.64 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0217675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3199  putative PAS/PAC sensor protein  29.92 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3510  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  34.62 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  33.06 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  30.65 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>