69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2658 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2658  Type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0554552  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2659  penicillin-binding protein 1A  57.35 
 
 		 287 aa  343  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2879  hypothetical protein  51.16 
 
 		 281 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0257502  hitchhiker  0.00113729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2361  exonuclease  43.18 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13094  normal  0.909289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3276  hypothetical protein  45.06 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000378061  hitchhiker  0.00588252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0945  ribosomal protein L15  41.49 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1265  hypothetical protein  38.43 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000338125  hitchhiker  0.000790963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1175  hypothetical protein  43.75 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00935505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3117  hypothetical protein  42.92 
 
 		 329 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3214  hypothetical protein  41.42 
 
 		 353 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00985541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3020  type IV pilus assembly protein PilM  42.92 
 
 		 328 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0040743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1081  hypothetical protein  42.92 
 
 		 357 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1141  hypothetical protein  42.92 
 
 		 359 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0266938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2938  hypothetical protein  42.5 
 
 		 328 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000623301  normal  0.325762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0941  type IV pilus assembly protein PilM  38.97 
 
 		 287 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00121158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3660  GGDEF  36.17 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1309  type IV pilus assembly protein PilM  40.42 
 
 		 291 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.701757  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0384  hypothetical protein  40.32 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.387534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1448  hypothetical protein  35.36 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1440  hypothetical protein  38.02 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1504  hypothetical protein  38.91 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400142  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2849  hypothetical protein  36.36 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2298  hypothetical protein  34.27 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2546  hypothetical protein  38.62 
 
 		 306 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1439  flavodoxin, long chain  35.86 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2386  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  37.39 
 
 		 295 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565719  hitchhiker  0.000735604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0672  hypothetical protein  33.1 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0133452  hitchhiker  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3152  hypothetical protein  32.76 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02723  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  37.86 
 
 		 306 aa  158  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1423  hypothetical protein  37.44 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3670  hypothetical protein  34.29 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.748354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2958  hypothetical protein  35.96 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43760  hypothetical protein  35.92 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0793  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6239  hypothetical protein  33.61 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0067  hypothetical protein  31.65 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836373  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6557  hypothetical protein  33.06 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2363  hypothetical protein  31.14 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4757  hypothetical protein  30.49 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0149  hypothetical protein  33.8 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0099  hypothetical protein  29.9 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.238666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3028  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.53 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2264  hypothetical protein  33.2 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3704  hypothetical protein  33.86 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126899 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0116  hypothetical protein  29.37 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1880  hypothetical protein  29.6 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.361492  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1829  hypothetical protein  30.08 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3539  hypothetical protein  29.67 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00713  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  30.38 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3407  hypothetical protein  31.84 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1464  hypothetical protein  32.31 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1702  hypothetical protein  30.58 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.594136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1745  hypothetical protein  28.99 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.043423  normal  0.315649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2998  hypothetical protein  29.81 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3538  hypothetical protein  29.44 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3294  hypothetical protein  33.65 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2084  hypothetical protein  32.86 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1440  hypothetical protein  30.67 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1023  hypothetical protein  32.97 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4007  SMF protein  29.14 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2655  hypothetical protein  26.72 
 
 		 300 aa  95.9  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3998  hypothetical protein  29.91 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0588  hypothetical protein  33.02 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.370107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2800  hypothetical protein  28.04 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.812024  hitchhiker  0.0000116766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3293  hypothetical protein  33.1 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1206  hypothetical protein  23.95 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0217675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3510  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  41.11 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1052  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3199  putative PAS/PAC sensor protein  24.48 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>