66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0588 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  733    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.370107  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2084  hypothetical protein  57.54 
 
 		 329 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2298  hypothetical protein  29.22 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0067  hypothetical protein  27.82 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43760  hypothetical protein  31.87 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6557  hypothetical protein  31.8 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1829  hypothetical protein  39.73 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2879  hypothetical protein  29.53 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0257502  hitchhiker  0.00113729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3670  hypothetical protein  30.33 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.748354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02723  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  29.74 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1440  hypothetical protein  30.61 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1448  hypothetical protein  30.65 
 
 		 309 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2658  Type IV pilus assembly protein PilM  33.02 
 
 		 288 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0554552  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1440  hypothetical protein  34.05 
 
 		 304 aa  93.6  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1504  hypothetical protein  31.31 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400142  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6239  hypothetical protein  29.57 
 
 		 293 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0384  hypothetical protein  26.36 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.387534  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1464  hypothetical protein  23.79 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2659  penicillin-binding protein 1A  31.18 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3660  GGDEF  27.9 
 
 		 293 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3152  hypothetical protein  25.82 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3276  hypothetical protein  31.35 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000378061  hitchhiker  0.00588252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1702  hypothetical protein  24.07 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.594136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0099  hypothetical protein  27.6 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.238666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1439  flavodoxin, long chain  30.85 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1745  hypothetical protein  25.25 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.043423  normal  0.315649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3117  hypothetical protein  25.4 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3407  hypothetical protein  27.46 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2938  hypothetical protein  25.81 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000623301  normal  0.325762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2849  hypothetical protein  27.72 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3020  type IV pilus assembly protein PilM  25.4 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0040743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1423  hypothetical protein  29.05 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0945  ribosomal protein L15  27.59 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0793  hypothetical protein  27.35 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2546  hypothetical protein  29.14 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2958  hypothetical protein  26.91 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00713  ABC-type amino acid transport/signal transduction system,periplasmic component/domain  32.58 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1265  hypothetical protein  26.67 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000338125  hitchhiker  0.000790963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0149  hypothetical protein  25.5 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2361  exonuclease  28.8 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13094  normal  0.909289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1052  hypothetical protein  24.14 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2363  hypothetical protein  27.24 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2264  hypothetical protein  26.15 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2386  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  30.46 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565719  hitchhiker  0.000735604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0672  hypothetical protein  27.86 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0133452  hitchhiker  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1141  hypothetical protein  24.19 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0266938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1081  hypothetical protein  24.19 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1175  hypothetical protein  24.19 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00935505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4757  hypothetical protein  23.9 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0941  type IV pilus assembly protein PilM  23.23 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00121158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3704  hypothetical protein  26.32 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3028  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.92 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3214  hypothetical protein  24.19 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00985541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0116  hypothetical protein  26.82 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3998  hypothetical protein  27.37 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4007  SMF protein  30.06 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2655  hypothetical protein  27.08 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1023  hypothetical protein  26.23 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3538  hypothetical protein  25.67 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1309  type IV pilus assembly protein PilM  21.13 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.701757  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3294  hypothetical protein  24.86 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2998  hypothetical protein  24.06 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1880  hypothetical protein  23.68 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.361492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3539  hypothetical protein  25.3 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2800  hypothetical protein  18.62 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.812024  hitchhiker  0.0000116766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3293  hypothetical protein  26.11 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.370888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>