244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2688 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  97.98 
 
 		 347 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  692    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  69.52 
 
 		 354 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  69.71 
 
 		 354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  68.3 
 
 		 354 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  68.59 
 
 		 354 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  69.66 
 
 		 327 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  67.8 
 
 		 327 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  68.39 
 
 		 330 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  72.7 
 
 		 329 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  68.21 
 
 		 327 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  68.37 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  67.6 
 
 		 324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  62.81 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  61.83 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  61.18 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  59.69 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  60.8 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  60.8 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  60.8 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  60.8 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  57.35 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  60.49 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  59.64 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  60.31 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  58.62 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  60.31 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  60 
 
 		 328 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  60.31 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  59.51 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  59.69 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  57.68 
 
 		 344 aa  349  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  56.71 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  59.66 
 
 		 353 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  56.71 
 
 		 341 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  57.55 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  55 
 
 		 341 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  49.41 
 
 		 338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  54.85 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  48.68 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  48.62 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.59 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  48.63 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  45.9 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  51.8 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  53.47 
 
 		 314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.39 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  51.79 
 
 		 323 aa  281  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  46.33 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  49.84 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  49.84 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  46.93 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  43.43 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  46.89 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  46.69 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  43.73 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  48.07 
 
 		 334 aa  271  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  45.16 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  44.76 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  44.41 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  47 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  43.99 
 
 		 308 aa  268  8e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  45.16 
 
 		 307 aa  268  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  49.52 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  48.84 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  49.2 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  48.39 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  45.03 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  46.71 
 
 		 316 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  43.13 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  48.33 
 
 		 321 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  48 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  47.8 
 
 		 320 aa  258  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  48 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  48 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  48 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  48 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  48 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  48 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  46.89 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  48 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  41.52 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  41.52 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  41.52 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  47.17 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  48.11 
 
 		 320 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  45.05 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  46.84 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  47.32 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  46.51 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  46.51 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  54.75 
 
 		 440 aa  252  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  43.69 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  47.62 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  46.51 
 
 		 337 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  43.56 
 
 		 324 aa  252  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  46.51 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 328 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  48.76 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>