More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2009 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  93.6 
 
 		 125 aa  240  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  78.23 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  79.03 
 
 		 125 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  78.23 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  45.19 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  45.13 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  50.46 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  50.46 
 
 		 125 aa  95.9  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  45.87 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  50.93 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  47.27 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  44.95 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  44.95 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  44.95 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  41.51 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  45.87 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  45.79 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  42.45 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  39.81 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  46.23 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  43.93 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  45.05 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 126 aa  85.9  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  47.22 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  42.06 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  43.64 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  36.94 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  35.54 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  38.02 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  40.38 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  39.09 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  39.05 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  35.34 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  36.52 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  41.96 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>