59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0903 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  99.12 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  94.69 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  74.67 
 
 		 226 aa  361  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  73.78 
 
 		 226 aa  358  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  75.56 
 
 		 222 aa  358  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  72.97 
 
 		 227 aa  348  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  72.97 
 
 		 227 aa  347  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  65.78 
 
 		 226 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  69.2 
 
 		 229 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  54.79 
 
 		 231 aa  231  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.12 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  29.14 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1139  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  33.07 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 305 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  48.9  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  28.41 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 240 aa  45.1  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  33.72 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  23.95 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  24.18 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.85 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  31.16 
 
 		 310 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  31.25 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.21 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2558  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 225 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.41 
 
 		 242 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 285 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 285 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.96 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>