More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0726 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
90 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  95.56 
 
 
90 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  49.43 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  49.43 
 
 
107 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 
110 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  49.32 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
107 aa  84  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  51.47 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  39.36 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  52.46 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  52.46 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  35.23 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  41.56 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  44.78 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  34.83 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
317 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.23 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
119 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
127 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.9 
 
 
115 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.9 
 
 
115 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 
115 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  39.71 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  42.19 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  36.71 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.88 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  40.98 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  47.46 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  42.65 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  45.07 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  39.71 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>