More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_87108 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_87108  Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter)  100 
 
 		 635 aa  1314    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.132654  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10845  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05830)  48.01 
 
 		 643 aa  561  1e-158  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.198608  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05323  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06870)  47.14 
 
 		 662 aa  551  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03980  hexose transport-related protein, putative  47.96 
 
 		 647 aa  538  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804864  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03210  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01560)  44.36 
 
 		 633 aa  503  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0576803 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02869  galactose-proton symport, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11790)  42.83 
 
 		 631 aa  465  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.833459  normal  0.61976 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06804  conserved hypothetical protein  40.03 
 
 		 619 aa  429  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408533  normal  0.253031 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02990  sugar transporter, putative  39.8 
 
 		 634 aa  423  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05060  hexose transport-related protein, putative  39.17 
 
 		 630 aa  422  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10812  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 		 636 aa  259  8e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  31.82 
 
 		 472 aa  210  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  31.82 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  31.82 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  31.82 
 
 		 472 aa  209  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  31.82 
 
 		 472 aa  209  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  31.82 
 
 		 472 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  31.82 
 
 		 472 aa  209  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  31.82 
 
 		 472 aa  209  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  30.18 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  31.6 
 
 		 472 aa  207  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48420  fructose symporter  30.1 
 
 		 511 aa  206  9e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.467105  normal  0.26394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  31.8 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  31.8 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  31.8 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  31.1 
 
 		 471 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  31.8 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  31.59 
 
 		 472 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  30.8 
 
 		 477 aa  201  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  29.54 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  30.2 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  29.4 
 
 		 472 aa  187  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  30.49 
 
 		 533 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  28.25 
 
 		 444 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  29.81 
 
 		 492 aa  183  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  30.84 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  30.84 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  30.84 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  30.84 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  31.52 
 
 		 566 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  30.84 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  30.63 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  30.63 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  30.63 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  30.63 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  30.63 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  30.63 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  30.63 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  28.98 
 
 		 550 aa  181  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02372  conserved hypothetical protein  39.74 
 
 		 523 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.366103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  30.63 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  30.42 
 
 		 464 aa  180  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  29.13 
 
 		 550 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  30.48 
 
 		 465 aa  178  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  27.96 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  30.64 
 
 		 517 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  28.6 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  29.57 
 
 		 450 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  33.15 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  33.15 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  30.47 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  30.28 
 
 		 448 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  30.13 
 
 		 516 aa  172  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  29.25 
 
 		 561 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02730  sugar transporter, putative  30.18 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  29.31 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  28.24 
 
 		 550 aa  170  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  28.18 
 
 		 446 aa  168  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39560  sugar transporter, putative  30.31 
 
 		 551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0538769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  28.54 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  30.64 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06923  High-affinity hexose transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874U9]  30.7 
 
 		 531 aa  167  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  29.3 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  28.83 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02794  conserved hypothetical protein similar to a fructose transporter (Eurofung)  33.43 
 
 		 409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0012636  normal  0.219855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  28.54 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  29.01 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  29.63 
 
 		 442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  31.8 
 
 		 544 aa  164  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  30.65 
 
 		 480 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  29.07 
 
 		 473 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  29.02 
 
 		 482 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07667  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.341465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  27.89 
 
 		 452 aa  162  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  27.04 
 
 		 468 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03400  hexose transport-related protein, putative  27.39 
 
 		 535 aa  161  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  30.49 
 
 		 456 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  27.65 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  28.89 
 
 		 491 aa  160  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  26.46 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  29.64 
 
 		 475 aa  160  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  29.79 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  28.04 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  29.36 
 
 		 467 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  28.85 
 
 		 473 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  26.99 
 
 		 445 aa  159  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  29.45 
 
 		 484 aa  158  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  25.11 
 
 		 474 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  28.12 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 		 561 aa  157  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00490  sugar transporter, putative  30.55 
 
 		 592 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.75075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>