141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67615 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_67615  predicted protein  100 
 
 		 705 aa  1429    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12346  predicted protein  27.03 
 
 		 408 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  30.68 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  30.68 
 
 		 241 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  26.06 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  23.03 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  25.93 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  27.61 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3855  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  27.61 
 
 		 232 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2765  hypothetical protein  22.98 
 
 		 231 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  25.93 
 
 		 230 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3765  hypothetical protein  23.72 
 
 		 223 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000370937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3598  hypothetical protein  23.72 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.350738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3884  hypothetical protein  23.72 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  23.46 
 
 		 241 aa  59.3  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  21.77 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  21.77 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  24.54 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  24.54 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  27.33 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1444  hypothetical protein  22.89 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000188634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  22.56 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  26.92 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  28.76 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  19.39 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  22.36 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3524  LrgB family protein  22.29 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  22.84 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  22.84 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  22.84 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2540  predicted protein  24.81 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  22.84 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  22.84 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  22.84 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  22.84 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  28.57 
 
 		 239 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  25.79 
 
 		 240 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  21.94 
 
 		 231 aa  57  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  23.93 
 
 		 231 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  29.57 
 
 		 241 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  27.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  25.15 
 
 		 231 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  26.99 
 
 		 241 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  25.15 
 
 		 231 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  25.15 
 
 		 231 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  25.15 
 
 		 231 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  24.36 
 
 		 238 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  25.15 
 
 		 231 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  25.32 
 
 		 231 aa  54.3  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  23.87 
 
 		 231 aa  54.3  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0431  LrgB-like protein  31.48 
 
 		 241 aa  54.3  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.09203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  30.36 
 
 		 240 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45887  predicted protein  27.62 
 
 		 524 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  34.83 
 
 		 255 aa  53.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  26.92 
 
 		 243 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  26.35 
 
 		 244 aa  53.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  24.34 
 
 		 238 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  26.92 
 
 		 243 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  29.8 
 
 		 239 aa  51.6  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  27.11 
 
 		 241 aa  51.6  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1326  LrgB family protein  31.07 
 
 		 238 aa  51.2  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.781498 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  24.03 
 
 		 235 aa  51.2  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  29.59 
 
 		 239 aa  51.2  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  25.95 
 
 		 238 aa  51.2  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  23.6 
 
 		 241 aa  50.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  24.03 
 
 		 235 aa  50.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  23.84 
 
 		 240 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2681  putative transmembrane protein, murein hydrolase LrgB like  25.75 
 
 		 240 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.888366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4093  LrgB family protein  25.74 
 
 		 231 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17883  normal  0.212309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  33.72 
 
 		 239 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2116  hypothetical protein  23.03 
 
 		 229 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0001189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  24.36 
 
 		 238 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  22.01 
 
 		 231 aa  49.7  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  24.53 
 
 		 238 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  26.17 
 
 		 228 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03101  LrgB-like protein  25.68 
 
 		 236 aa  49.3  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0895138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  29.57 
 
 		 229 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  29.57 
 
 		 229 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  21.08 
 
 		 228 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  29.57 
 
 		 229 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  29.57 
 
 		 229 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  21.94 
 
 		 238 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  23.9 
 
 		 244 aa  48.5  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  29.57 
 
 		 229 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28740  putative effector of murein hydrolase  32.63 
 
 		 232 aa  48.5  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  35.85 
 
 		 239 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  22.64 
 
 		 229 aa  48.9  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  24.24 
 
 		 232 aa  48.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  25.45 
 
 		 236 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1229  LrgB-like family protein  27.1 
 
 		 240 aa  47.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  25.47 
 
 		 224 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  25.45 
 
 		 236 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  24.86 
 
 		 238 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1148  hypothetical protein  26.79 
 
 		 231 aa  47.4  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  25.47 
 
 		 224 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  20.12 
 
 		 228 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  21.88 
 
 		 238 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  21.88 
 
 		 238 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  22.97 
 
 		 238 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>