89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66970 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03067  DNA polymerase epsilon catalytic subunit A (DNA polymerase II subunit A)(EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93845]  51.41 
 
 		 2207 aa  2250    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.958905 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_150  predicted protein  37.98 
 
 		 2198 aa  1479    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.710895  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66970  DNA-directed DNA polymerase epsilon, catalytic subunit A  100 
 
 		 2222 aa  4627    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363259 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01430  DNA polymerase epsilon, catalytic subunit a, putative  45.38 
 
 		 2250 aa  1931    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352674  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_52678  DNA polymerase epsilon catalytic subunit that participates with PCNA in late in S phase DNA replication  36.32 
 
 		 2155 aa  1356    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  26.46 
 
 		 792 aa  67  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.2 
 
 		 789 aa  64.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  24.31 
 
 		 781 aa  63.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  24.02 
 
 		 792 aa  64.3  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  28.29 
 
 		 743 aa  61.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  23.75 
 
 		 780 aa  62.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  23.85 
 
 		 780 aa  61.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  25.76 
 
 		 786 aa  61.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  21.67 
 
 		 789 aa  58.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  23.7 
 
 		 787 aa  58.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  24.64 
 
 		 788 aa  58.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  22.33 
 
 		 789 aa  58.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  22.33 
 
 		 789 aa  58.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  23.84 
 
 		 786 aa  58.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  23.06 
 
 		 810 aa  57.4  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  25 
 
 		 789 aa  57.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  22.46 
 
 		 794 aa  57  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  21.38 
 
 		 794 aa  57  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  21.38 
 
 		 794 aa  57  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  23.44 
 
 		 811 aa  56.2  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 816 aa  55.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.43 
 
 		 790 aa  55.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  25.09 
 
 		 786 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  24.31 
 
 		 793 aa  54.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.57 
 
 		 782 aa  54.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  23.55 
 
 		 787 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.21 
 
 		 794 aa  55.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  22.87 
 
 		 810 aa  53.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  24.6 
 
 		 795 aa  53.5  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  23.27 
 
 		 786 aa  53.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  24.68 
 
 		 794 aa  53.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  22.86 
 
 		 810 aa  53.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  23.27 
 
 		 786 aa  52.4  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  20.5 
 
 		 787 aa  52.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  22.77 
 
 		 787 aa  52  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 786 aa  52  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  25.65 
 
 		 784 aa  52  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  21.48 
 
 		 787 aa  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  23.88 
 
 		 784 aa  51.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  25.17 
 
 		 854 aa  51.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  22.56 
 
 		 791 aa  51.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  22.1 
 
 		 793 aa  51.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  22.5 
 
 		 810 aa  50.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 808 aa  50.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  24.2 
 
 		 910 aa  50.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  23.58 
 
 		 820 aa  50.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  24.84 
 
 		 853 aa  50.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  21.48 
 
 		 787 aa  49.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  22.73 
 
 		 791 aa  49.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  24.18 
 
 		 723 aa  49.7  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  22.91 
 
 		 792 aa  49.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3187  DNA polymerase B, exonuclease  25.64 
 
 		 744 aa  49.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163636 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  25.47 
 
 		 788 aa  49.3  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  22.31 
 
 		 788 aa  48.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  24.64 
 
 		 795 aa  48.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3245  DNA polymerase II, putative  20.86 
 
 		 745 aa  49.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  25.57 
 
 		 853 aa  48.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  22.38 
 
 		 932 aa  48.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  26.29 
 
 		 800 aa  48.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  20.86 
 
 		 788 aa  48.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  24.76 
 
 		 854 aa  48.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  23.76 
 
 		 783 aa  48.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.76 
 
 		 783 aa  48.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  22.78 
 
 		 788 aa  48.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  22.53 
 
 		 790 aa  47.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  23.76 
 
 		 783 aa  48.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  23.76 
 
 		 783 aa  47.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  25.65 
 
 		 835 aa  47.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.76 
 
 		 783 aa  48.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  23.76 
 
 		 783 aa  48.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.76 
 
 		 783 aa  48.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  20.98 
 
 		 816 aa  48.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  21.78 
 
 		 797 aa  48.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.14 
 
 		 783 aa  48.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  24.06 
 
 		 788 aa  47.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  24.87 
 
 		 786 aa  47  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  24.71 
 
 		 783 aa  47  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  24.63 
 
 		 783 aa  46.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  24.63 
 
 		 783 aa  46.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  26.06 
 
 		 990 aa  46.2  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  24.63 
 
 		 783 aa  46.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  26.29 
 
 		 796 aa  45.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  23.55 
 
 		 852 aa  45.8  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  22.7 
 
 		 982 aa  45.8  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>