More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30643 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  100 
 
 		 581 aa  1196    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  37.11 
 
 		 481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  39.4 
 
 		 536 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  38.05 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  37.7 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  37.66 
 
 		 491 aa  279  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  38.12 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  37.74 
 
 		 491 aa  277  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  38.84 
 
 		 574 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  37.17 
 
 		 519 aa  277  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  37.4 
 
 		 491 aa  277  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  37.93 
 
 		 491 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  37.93 
 
 		 491 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  38 
 
 		 491 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  37.43 
 
 		 491 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  36.99 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  37.36 
 
 		 491 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  36.99 
 
 		 528 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  36.99 
 
 		 528 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  38.89 
 
 		 540 aa  270  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  36.99 
 
 		 528 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  36.99 
 
 		 528 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  36.99 
 
 		 528 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  36.99 
 
 		 528 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  36.24 
 
 		 526 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  38.36 
 
 		 540 aa  267  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  36.45 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  36.01 
 
 		 540 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  36.64 
 
 		 610 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  35.54 
 
 		 543 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  34.39 
 
 		 544 aa  234  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  36.85 
 
 		 475 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  35.61 
 
 		 533 aa  223  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  33.65 
 
 		 526 aa  217  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  32.39 
 
 		 536 aa  213  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  32.42 
 
 		 536 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  32.17 
 
 		 536 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  32.02 
 
 		 536 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  32.02 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  31.83 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  32.02 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  32.02 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  31.45 
 
 		 536 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  31.13 
 
 		 533 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  30.76 
 
 		 509 aa  203  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3057  amidase  35.07 
 
 		 513 aa  196  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  31.96 
 
 		 530 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  29.68 
 
 		 519 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  32.87 
 
 		 468 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  32.12 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  28.1 
 
 		 542 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.46 
 
 		 491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  29.64 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  38.61 
 
 		 559 aa  160  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.93 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.23 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.96 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.25 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.88 
 
 		 491 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  35.21 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.9 
 
 		 486 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.56 
 
 		 483 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3176  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  29.07 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  26.11 
 
 		 567 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  33.66 
 
 		 567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.39 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2932  amidase  33.01 
 
 		 567 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4623  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.9 
 
 		 491 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.17 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  41.98 
 
 		 497 aa  134  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.64 
 
 		 486 aa  134  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  28.89 
 
 		 466 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  27.79 
 
 		 566 aa  133  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.31 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2341  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.91 
 
 		 485 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  27.52 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.45 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.89 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.04 
 
 		 482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0869  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  32.57 
 
 		 481 aa  130  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0362034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.6 
 
 		 489 aa  130  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.09 
 
 		 485 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.71 
 
 		 486 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4474  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.53 
 
 		 483 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.01 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06951  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  27.92 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.95 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.66 
 
 		 1806 aa  128  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.33 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2840  amidase  26.11 
 
 		 567 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845019  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.57 
 
 		 484 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.83 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.6 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.4 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  31.7 
 
 		 570 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0167  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.21 
 
 		 484 aa  127  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0075  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.18 
 
 		 485 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.281052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.94 
 
 		 489 aa  127  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  29.92 
 
 		 534 aa  127  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>