66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_54656 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_54656  HSP20  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.222487  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35158  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860566  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36981  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46448  predicted protein  29.19 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  28.81 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1100  heat shock protein Hsp20  30.65 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000787218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  29.75 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 		 141 aa  48.9  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43797  predicted protein  37.97 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  32.29 
 
 		 155 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  28.04 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1230  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  28.07 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  28.35 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  22.75 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  27.18 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  27.18 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  30.38 
 
 		 132 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  28.32 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  24.11 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  27.48 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1099  heat shock protein Hsp20  28.81 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000114288  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  27.83 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  28 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  29.09 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  30.86 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.93 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  29.29 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  30.86 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  25.95 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  27.56 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  25.44 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  30.49 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  27.48 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 139 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  23.4 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  29.36 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  30.3 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  25 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  32.29 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  26.26 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  27.87 
 
 		 139 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0537  heat shock protein Hsp20  25.85 
 
 		 140 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  24.78 
 
 		 158 aa  41.6  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  28.15 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  28.15 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  28.15 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  28.15 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  28.15 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  28.15 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 		 146 aa  41.6  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 		 160 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  28.16 
 
 		 126 aa  41.6  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54150  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 		 363 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>