More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13470 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13470  predicted protein  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  38.34 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  36.51 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  36.27 
 
 		 236 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  36.98 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  37.5 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  35.94 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  36.27 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  31.96 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  34.74 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  35.9 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  34.74 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  37.63 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6711  predicted protein  37.44 
 
 		 189 aa  107  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00445618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 218 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  36.92 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  36.08 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  35.9 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  33.85 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  34.87 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  34.9 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  35.9 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  35.05 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  35.9 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  35.71 
 
 		 214 aa  104  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  34.87 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  35 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  31.96 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  34.38 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  31.96 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  35.23 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  36.08 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  35.05 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  34.87 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  34.87 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  35.9 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  36.41 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  33.68 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  35.9 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  34.87 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  33.68 
 
 		 221 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  34.5 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  30.57 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  36.27 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  34.2 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  33.85 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  35.05 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  32.8 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  34.34 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  35.05 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  34.36 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  35.05 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  35.57 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  32.66 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  29.69 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  34.87 
 
 		 338 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  34.87 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  33.68 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  34.02 
 
 		 198 aa  98.6  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  32.31 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  29.38 
 
 		 216 aa  98.2  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  37.5 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  36.08 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 279 aa  98.2  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>