More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9171 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  100 
 
 
93 aa  198  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 
492 aa  85.5  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  39.51 
 
 
731 aa  79.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371345 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  43.82 
 
 
513 aa  78.2  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  43.18 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  34.12 
 
 
570 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  43.37 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  40.79 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  46.75 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  35.87 
 
 
555 aa  71.2  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  36.25 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  36.59 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.94 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  36.59 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  36.59 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  40.58 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  36.59 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  38.55 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  35.37 
 
 
302 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  36.59 
 
 
223 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  37.97 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  37.8 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  41.54 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  37.8 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  35.37 
 
 
285 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_7719  predicted protein  43.75 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0652282  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  36.78 
 
 
368 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  49.12 
 
 
272 aa  64.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  38.1 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  46.03 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  34.94 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  37.35 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  37.35 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  37.35 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  37.35 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  40.98 
 
 
184 aa  63.5  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  41.27 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  34.15 
 
 
286 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  34.38 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  34.15 
 
 
286 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  35.37 
 
 
318 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  37.35 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  34.94 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  35 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  35.8 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  36.71 
 
 
285 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  34.44 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  34.44 
 
 
290 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  37.68 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  34.44 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  43.48 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  36.92 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  32.93 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  32 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  32 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  34.92 
 
 
287 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  34.94 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  36.47 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  38.1 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  36.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  36.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  36.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  36.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  33.73 
 
 
281 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  39.13 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  36.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  36.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  36.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  34.78 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  36.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  36.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  34.94 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  39.68 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.33 
 
 
290 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  38.16 
 
 
286 aa  60.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  33.85 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  30.26 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  32.56 
 
 
330 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  33.73 
 
 
281 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  33.72 
 
 
286 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  39.13 
 
 
107 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  33.85 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  36.23 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  35.38 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  36.62 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  35.06 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  37.68 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  36.23 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  31.88 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.71 
 
 
289 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  42.86 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  36.23 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>