62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12265 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  100 
 
 		 208 aa  397  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  49.74 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  38.83 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7690  predicted protein  44.61 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.113136  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  121  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  42.57 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45794  predicted protein  32.31 
 
 		 286 aa  103  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  37.13 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  36.1 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  35.89 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  33.02 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  30.81 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  28.16 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  28.92 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  31.63 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  31.28 
 
 		 256 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  29.73 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  33 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  30.58 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  28.72 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  33.17 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  28.28 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  28.84 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  27.86 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  26.21 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04690  vacuole protein, putative  38.71 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  27.62 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  26.92 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  26 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  26.34 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  29.95 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  34.34 
 
 		 516 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  21.36 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  25.95 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  27.96 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  25.89 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  38.03 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  29.56 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  26.87 
 
 		 360 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  27.23 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  25.39 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  28.14 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  28.28 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  23.9 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  27 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  25.82 
 
 		 302 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  36.62 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  36.62 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  25.37 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  27.32 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  28.97 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  25.68 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  25.27 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  34.12 
 
 		 115 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  22.7 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  23.31 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  26.46 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  26.8 
 
 		 185 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  40 
 
 		 124 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  35.62 
 
 		 116 aa  41.6  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  31.71 
 
 		 90 aa  41.6  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>