More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0227 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 461 aa  938    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  55.7 
 
 		 453 aa  536  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  54.92 
 
 		 458 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  55.31 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  55.46 
 
 		 453 aa  512  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  54.17 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  54.92 
 
 		 461 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  54.17 
 
 		 455 aa  504  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  52.07 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  53.35 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  47.26 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  48.26 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  47.91 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  47.69 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  47.46 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  47.46 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  47.42 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  46.49 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  48.48 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 448 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  47.6 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  46.92 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  45.83 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  45.77 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  46.83 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  46.07 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  45.77 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  46.19 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  45.36 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  45.51 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  45.3 
 
 		 452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  46.15 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  46.71 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  44.18 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  43.64 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  47.05 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  44.18 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  44.18 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  45.01 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  43.54 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  43.54 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  43.54 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  45.49 
 
 		 452 aa  398  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  44.32 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  46.41 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  43.98 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  44.2 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  44.23 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  44.08 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  44.08 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  43.54 
 
 		 455 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3219  DNA repair protein RadA  43.27 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  45.14 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  43.71 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  47.99 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  44.47 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  44.08 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2814  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  44.03 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3358  DNA repair protein RadA  43.27 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.918494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  45.2 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  44.01 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0667  DNA repair protein RadA  42.98 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0825  DNA repair protein RadA  44.83 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  44.13 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  45.2 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3659  DNA repair protein RadA  45.24 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.217436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1148  DNA repair protein RadA  43.27 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1045  DNA repair protein RadA  43.05 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.665867  normal  0.0445974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1110  DNA repair protein RadA  43.05 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  47.03 
 
 		 462 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1049  DNA repair protein RadA  43.05 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>