229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4113 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  55.83 
 
 
206 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  59.9 
 
 
219 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  53.37 
 
 
224 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  69.48 
 
 
207 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  55.56 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  55.76 
 
 
210 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  58.39 
 
 
206 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  50.33 
 
 
161 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  48.03 
 
 
236 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  46.41 
 
 
165 aa  142  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  46.71 
 
 
219 aa  141  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  51.3 
 
 
157 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  46.05 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  43.42 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  44.44 
 
 
161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  36.91 
 
 
155 aa  96.7  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92891  predicted protein  45.67 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.399442  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32792  predicted protein  34.06 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  32.31 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  47.56 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32132  predicted protein  28.9 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  38.37 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  32.08 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  32.08 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37585  predicted protein  28.42 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  31.16 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33223  predicted protein  35.8 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0013315  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  31.41 
 
 
280 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1292  hypothetical protein  37.65 
 
 
192 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.263548  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3025  hypothetical protein  34.48 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  41.25 
 
 
287 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  35.71 
 
 
174 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  31.85 
 
 
148 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2883  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1397  hypothetical protein  38.14 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43583  predicted protein  38.1 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  32.22 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  32 
 
 
163 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
271 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0306  hypothetical protein  25.2 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.407855 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.79 
 
 
471 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.57 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 
293 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.72 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  32.22 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 
293 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.72 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
277 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.42 
 
 
415 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  31.11 
 
 
541 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.22 
 
 
293 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.5 
 
 
296 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
295 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  31.11 
 
 
541 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  34.18 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  31.11 
 
 
541 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  29.09 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
282 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.98 
 
 
308 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  31.11 
 
 
541 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  33.75 
 
 
378 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  28.89 
 
 
360 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.73 
 
 
308 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.85 
 
 
295 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  32.53 
 
 
248 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.36 
 
 
280 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  29.66 
 
 
387 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.29 
 
 
411 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.44 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  29.66 
 
 
387 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  30 
 
 
248 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.85 
 
 
307 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  27.27 
 
 
288 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  29.66 
 
 
387 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2293  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.41 
 
 
414 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000690855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3697  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.18 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.02 
 
 
442 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  31.65 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.57 
 
 
420 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
382 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  26.57 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  39.62 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.18 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  24.09 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.83 
 
 
280 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
279 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.18 
 
 
279 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  29 
 
 
316 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 
541 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.57 
 
 
277 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.58 
 
 
294 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  25.44 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.18 
 
 
296 aa  45.8  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
248 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  30.26 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.65 
 
 
308 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>