19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1292 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1292  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.263548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  37.65 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  38.2 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  37.5 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  37.37 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  35.96 
 
 		 265 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  34.21 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  28.44 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0271  hypothetical protein  34.12 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  33.73 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  39.13 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  33.75 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  30.16 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  30.3 
 
 		 228 aa  42  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  30.3 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3025  hypothetical protein  31.11 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  32.53 
 
 		 219 aa  41.2  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  29.27 
 
 		 246 aa  41.2  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>