More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2405 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 263 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  65.02 
 
 		 269 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  65.91 
 
 		 270 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  33.08 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  29.66 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  29.73 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  27.91 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  27.91 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  30.6 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  27.41 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  27.5 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  30.94 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  30.94 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  30.94 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  30.94 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  30.3 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  29.92 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  29.92 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  30.3 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  30.3 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  29.92 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  29.55 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  29.92 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  25.1 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.3 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.41 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  24.33 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  24.71 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  24.71 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  24.71 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  24.71 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  24.71 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  24.71 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  24.71 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  30.94 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  29.01 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  27.82 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  24.71 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  27.51 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  24.33 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  25.87 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  26.52 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  28.21 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  25.19 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  26.77 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  23.57 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  27.99 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  23.19 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  23.19 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  23.19 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  23.19 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.84 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  24.82 
 
 		 285 aa  86.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  26.32 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.07 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  25.28 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  26.3 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  26.71 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  23.51 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.83 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  23.17 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  22.43 
 
 		 265 aa  72  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.38 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  26.2 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  26.3 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.19 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.27 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.82 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  26.81 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  22.81 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  22.81 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  25.66 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  25.46 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  24.73 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  25.54 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  24.73 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.73 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.94 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  24.82 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  24.73 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  22.63 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  22.43 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  24.73 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  23.27 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.19 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  23.86 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  29.19 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  25.18 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>