More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0157 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 285 aa  587  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.3 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00157591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  29.86 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.84 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.09 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.03 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  25.96 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.48 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  25.59 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  26.3 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  26.37 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  33.86 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  25.93 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  25.85 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  25.54 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  36.79 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  36.79 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2751  Cof-like hydrolase  37.6 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.181052  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  36.79 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  36.79 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  27.04 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  33.96 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.46 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  43.21 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  25.53 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  24.74 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  35.85 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  25.54 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  25.1 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  34.62 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.91 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.91 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  25.99 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  27.18 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.83 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  33.65 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.91 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  26.74 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  24.22 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.67 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1482  Cof-like hydrolase  33.93 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00113579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  33.65 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  33.02 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  33.02 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  33.02 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1759  HAD-superfamily cof-like hydrolase  24.74 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  33.02 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  33.02 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  33.02 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  33.02 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  25.91 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  33.02 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  26.06 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0365  HAD superfamily hydrolase  32.56 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.231869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  27.43 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  30.93 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  23.4 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  30.93 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.93 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2261  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000564969  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf520  COF family HAD hydrolase protein, conserved  25.8 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4072  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.04 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0578925 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  30.93 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3962  HAD superfamily hydrolase  36.04 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  30.93 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  36.04 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.93 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  27.4 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3808  HAD superfamily hydrolase  36.04 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0549007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  30.93 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4271  HAD superfamily hydrolase  36.04 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.596112  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  34 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  25.09 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  24.34 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  26.13 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  24.37 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  26.19 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  25.62 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.46 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  25.09 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  24.81 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  22.99 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  35.14 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.9 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.14 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  43.37 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>