41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70310 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  94.53 
 
 		 425 aa  784    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  81.09 
 
 		 427 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  819    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  45.34 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  46.13 
 
 		 420 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  39.39 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  25.57 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  24.01 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  23.32 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  24.05 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  23.24 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  24.53 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  24.37 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  22.36 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  20.54 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  28.57 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  22.58 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  21.98 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  21.56 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  23.53 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  21.72 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  21.38 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  22.79 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  23.12 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  23.33 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  22.06 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.19 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  28.27 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  24.32 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  25.95 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  28.27 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  28.27 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  21.62 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  24.57 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  23.39 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  22.09 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  24.4 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  27.23 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  24.47 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  24.47 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  22.94 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>