54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67380 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  100 
 
 
312 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  49.68 
 
 
431 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  51.77 
 
 
313 aa  285  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  50 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  48.41 
 
 
341 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  49.04 
 
 
341 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  49.04 
 
 
341 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  48.41 
 
 
341 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  48.73 
 
 
341 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  50.47 
 
 
359 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  50.47 
 
 
359 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  50.47 
 
 
346 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  50.47 
 
 
346 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  50.47 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  50.47 
 
 
359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  50.16 
 
 
359 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  47.12 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  50 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  47.74 
 
 
355 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  45.63 
 
 
330 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  47.27 
 
 
328 aa  255  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  46.35 
 
 
367 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  42.16 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  38.23 
 
 
318 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  37.59 
 
 
290 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  39.24 
 
 
304 aa  152  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  38.1 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5834  hypothetical protein  73.81 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5835  fatty acid desaturase domain-containing protein  70.45 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.805516  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  26.71 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  26.33 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  27.24 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  30.04 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  31.76 
 
 
486 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  26.28 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  26.28 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  26.28 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  26.28 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  26.69 
 
 
315 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.28 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.28 
 
 
540 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  25 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  26.95 
 
 
489 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  23.95 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  22.41 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  24.1 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  23.14 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  21.56 
 
 
343 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  25.17 
 
 
360 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  25.17 
 
 
360 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  25.77 
 
 
360 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  21.56 
 
 
343 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  25.26 
 
 
360 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  24.41 
 
 
363 aa  42.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>