101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49760 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  100 
 
 
325 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  48.36 
 
 
312 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  50.17 
 
 
312 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  47.04 
 
 
312 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  47.8 
 
 
312 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  47.8 
 
 
312 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  45.83 
 
 
331 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  47.46 
 
 
312 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  45.51 
 
 
331 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  45.51 
 
 
331 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  45.51 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  45.51 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  45.51 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  45.51 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  45.51 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  46.05 
 
 
321 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  46.05 
 
 
321 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  45.43 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  45.43 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  45.19 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  45.19 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  45.19 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  45.19 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  38.54 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  39.73 
 
 
294 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  39.73 
 
 
294 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  39.73 
 
 
294 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  38.7 
 
 
294 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  31.88 
 
 
298 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  31.21 
 
 
299 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.21 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  30.74 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  30.74 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.18 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  29.78 
 
 
303 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  31.88 
 
 
303 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
295 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  30.55 
 
 
292 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  32.09 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  29.73 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
301 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  30.67 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  27.59 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  26.42 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  25.99 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  25.24 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  29.88 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  29.6 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.97 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  29.44 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
302 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  28.63 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  22.26 
 
 
293 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  21.73 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  29.8 
 
 
318 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  26.03 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  23.13 
 
 
455 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  21.43 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  20.3 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
315 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  21.76 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3026  putative glycosyltransferase  20.41 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  21.07 
 
 
489 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
378 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
305 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  29.59 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  18.82 
 
 
970 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
272 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  25.97 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  25.19 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  24.03 
 
 
297 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>