More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 297 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 297 aa  292  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  48.15 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 297 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 301 aa  281  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  48.3 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  46.13 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  46.64 
 
 		 300 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  46.46 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  49.15 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  44.26 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  46.55 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 297 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  47.96 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  45.3 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  44.26 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  48.66 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  48.47 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  45.12 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  44.41 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 298 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2045  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 306 aa  258  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 297 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 297 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  46.69 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  48.47 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  44.03 
 
 		 301 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6827  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 304 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5478  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  47.02 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5384  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4886  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 297 aa  251  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  45.58 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  45.76 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  42.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  43.66 
 
 		 296 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  47.32 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  46.78 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  45.58 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5627  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6375  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.429031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  45.57 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  46.96 
 
 		 300 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  46.96 
 
 		 300 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 296 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  43.39 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  43.39 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>